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广东省猪生殖与呼吸综合征病毒主要结构蛋白基因的变异分析

广东省猪生殖与呼吸综合征病毒主要结构蛋白基因的变异分析

作     者:王旭荣 宋长绪 杨增岐 王刚 李春玲 王贵平 黄忠 祝卫国 WANG Xu-rong;SONG Chang-xu;YANG Zeng-qi;WANG Gang;LI Chun-ling;WANG Gui-ping;HUANG Zhong;ZHU Wei-guo

作者机构:西北农林科技大学陕西杨凌712100 广东省农业科学院兽医研究所广东广州510640 

基  金:广东省自然科学基金项目(31990和04002083) 国家高技术研究发展计划(863)项目(2003AA241110) 国家食品安全重大专项(2001BA804A31) 

出 版 物:《中国兽医科技》 (Chinese Journal of Veterinary Science and Technology)

年 卷 期:2005年第35卷第4期

页      码:261-266页

摘      要:根据GenBank中猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲株(ATCC VR-2332)基因序列分别设计合成了针对PRRSV ORF3、ORF5和ORF6基因的引物,利用RT-PCR从广东省送检的5份病料中均分别扩增得到了大小约787、630和550 bp的片段,将扩增的cDNA片段克隆入pMD 18-T载体并测序.应用DNAStar软件分析,并与国内外已发表毒株和疫苗株(RespPRRS/Repro、RespPRRS MLV)、LV4.2.1株的序列进行比较.结果显示,这5个毒株与CH-1a、HB-1(sh)、BJ-4、ATCC VR-2332、疫苗株等毒株ORF3、ORF5、ORF6的核苷酸同源性分别为87.2%~98.7%、85.4%~96.8%、91.8%~98.9%,推导的氨基酸同源性分别为84.6%~97.6%、84.5%~95.5%、94.8%~98.9%;而与LV4.2.1株的核苷酸同源性分别为56.1%~58.3%、54.4%~57.0%、62.2%~64.4%,推导的氨基酸同源性分别为53.9%~56.7%、54.0%~57.0%、78.0%~80.3%.基因系统发育树表明,广东省流行的PRRSV与HB-1(sh)株的亲缘关系比较近.

主 题 词:猪生殖与呼吸综合征病毒 结构蛋白基因 广东省 变异分析 核苷酸同源性 氨基酸同源性 GenBank PRRSV ORF6基因 RT-PCR cDNA片段 设计合成 基因序列 软件分析 BJ-4 ATCC 系统发育 亲缘关系 疫苗株 T载体 毒株 国内外 推导 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1673-4696.2005.04.004

馆 藏 号:203881384...

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