基于自然群体随机交配的单个印迹QTL定位的初步研究

作     者：郑珂晖 黎哲镇 叶景山 周富杰 温永仙 ZHENG Ke-hui;LI Zhe-zhen;YE Jing-shan;ZHOU Fu-jie;WEN Yong-xian

作者机构：福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建农林大学计算机与信息学院福建福州350002 

基　　金：国家自然科学基金项目(31571558) 福建省自然科学基金项目(2017J01606) 福建农林大学科技创新专项基金(KFA17028A) 

出 版 物：《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2019年第34卷第12期

页      码：1364-1370页

摘      要：【目的】探索基于自然群体随机交配的单个印迹QTL的定位方法,分析影响定位准确性的关键因素。【方法】若印迹QTL决定的某一性状为数量性状,假设该性状与标记之间的关系存在线性关系,可以采用最小二乘法进行印迹QTL定位和遗传参数的估计。利用计算机模拟单点模拟标记、水稻真实自然群体标记进行印迹QTL定位,比较在不同最小等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)、不同遗传率、不同随机交配轮数下的统计功效与参数估计精度,印迹QTL的显著性采用F检验和t检验。【结果】通过模拟研究,证明该试验设计对于检测单个印迹QTL是有效的,在MAF大于5%时,印迹遗传率大于10%时,定位与遗传参数估计趋于无偏。【结论】采用自然群体随机交配产生作图群体,可以用来进行单个印迹QTL的定位,定位的结果较好,是一种有效的试验设计,为下一步进行多个印迹QTL奠定了基础。

主 题 词：自然群体 关联分析 F检验 印迹QTL 随机交配 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.19303/j.issn.1008-0384.2019.12.002

馆 藏 号：203882894...