柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

作     者：王福生 余洪 胡洲 管德龙 张盼 朱世平 赵晓春 WANG Fusheng;YU Hong;HU Zhou;GUAN Delong;ZHANG Pan;ZHU Shiping;ZHAO Xiaochun

作者机构：西南大学/中国农业科学院柑桔研究所重庆400712 国家柑桔工程技术研究中心重庆400712 陕西师范大学生命科学学院西安710119 

基　　金：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26) 重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目 西南大学双一流学科建设项目 中国博士后科学基金项目(2017M622946) 重庆市博士后科研项目(XmT2018062) 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2020年第47卷第1期

页      码：23-40页

摘      要：分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子,含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明,CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。q RT-PCR分析结果显示,大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。

主 题 词：柑橘属 SAUR基因家族 基因表达 全基因组鉴定 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 0834[0834] 

核心收录：

D　O　I：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0581

馆 藏 号：203882941...