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水牛CART基因的克隆测序及蛋白质结构与功能预测

水牛CART基因的克隆测序及蛋白质结构与功能预测

作     者:于农淇 鄢胜飞 覃广胜 尚江华 郑海英 杨春艳 YU Nongqi;YAN Shengfei;QIN Guangsheng;SHANG Jianghua;ZHENG Haiying;YANG Chunyan

作者机构:中国农业科学院广西水牛研究所/广西水牛遗传繁育重点实验室广西南宁530001 

基  金:广西科技计划项目(桂科AB16380040) 广西水牛研究所基本科研业务费项目(水牛基180503) 

出 版 物:《畜牧与兽医》 (Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期:2020年第52卷第2期

页      码:1-6页

摘      要:为探讨水牛可卡因-苯丙胺调节转录肽(cocaine-and amphetamine-regulated transcript,CART)基因功能,以水牛卵巢组织RNA转录的cDNA为模板,参考GenBank预测的水牛CART基因组序列设计引物,采用PCR和在线生信分析软件对CART基因进行克隆和蛋白质结构预测分析。结果显示:水牛CART基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸;对所得核酸序列和蛋白质结构分析预测显示,水牛CART基因与美洲野牛、野牦牛、普通牛、羊、双峰驼、单峰驼、野猪、马、非洲野驴、人类及猕猴相似程度分别为100%、98%、100%、98%、91%、91%、78%、85%、85%、81%、90%;Mega分析显示在多胃反刍动物间有较高同源性;蛋白质结构预测显示,CART蛋白含有N端信号肽,是分泌蛋白,功能与神经、辅酶和离子结合相关。

主 题 词:CART 水牛 蛋白质功能预测 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

馆 藏 号:203884131...

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