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自由能微扰法计算酶和抑制剂的相对结合自由能

自由能微扰法计算酶和抑制剂的相对结合自由能

作     者:章威 侯廷军 徐筱杰 

作者机构:北京大学化学与分子工程学院北京100871 

基  金:国家自然基金重点资助项目(No:29992590-2 29873003) 

出 版 物:《计算机与应用化学》 (Computers and Applied Chemistry)

年 卷 期:2002年第19卷第1期

页      码:13-14页

摘      要:用自由能微扰方法(FEP)计算了2种hydroxamate类的抑制剂和MMP-2的相对结合自由能,自由能计算采用了慢增长(Slow Growth)和固定窗口增长(Fixed Width Window Growth)2种方法,并且在每次计算中都采用了双向采样(double-wide sampling)的策略,2种方法计算得到的相对结合自由能都能和实验值很好地符合。

主 题 词:自由能微扰 MMP-2 Gelatinase-A hydroxamate类抑制剂 抗癌药物 药物设计 相对结合自由能 水解酶 

学科分类:1007[医学-药学类] 100701[100701] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1001-4160.2002.01.004

馆 藏 号:203889447...

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