荧光定量RT-PCR检测柯萨奇病毒A组6和10型的方法建立及应用

作     者：苏旭 吕莉琨 李力 杨东靖 李佳萌 谭昭麟 SU Xu;LV Li-kun;LI Li;YANG Dong-jing;LI Jia-meng;TAN Zhao-lin

作者机构：天津市疾病预防控制中心病原生物检测所天津300011 

基　　金：国家重大传染病防治科技重大专项项目(2012ZX10004209) 天津市疾病预防控制中心科技基金项目(CDCKY1303) 

出 版 物：《国际病毒学杂志》 (International Journal of Virology)

年 卷 期：2015年第22卷第6期

页      码：372-375页

摘      要：目的 建立柯萨奇病毒A组6（Coxsackievirus A6,CVA6）和10型（CVA10）的SYBRGreen Ⅰ荧光定量RT-PCR方法并进行评价及初步应用.方法 根据GenBank上的CVA6和CVA10序列,分别设计特异性引物,建立SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR方法体系,并分别进行灵敏度,重复性和特异性检测,然后利用该方法对649份2014年天津市未明确分型的肠道病毒阳性标本进行检测.结果 成功建立CVA6和CVA10的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法及定量标准曲线,其检出限均为101 copies/μL,重复性实验的变异系数均小于2％.该方法特异性强,与柯萨奇病毒（A组2、4、5、16型）、肠道病毒EV71型、诺如病毒、轮状病毒、麻疹病毒和乙型流感病毒均无交叉反应.利用该方法检测649份未分型标本,发现136份为CVA6阳性和174份为CVA10阳性,分别占未分型阳性标本的20.96％和26.81％.结论 本研究建立的检测CVA6和CVA10荧光定量RT-PCR方法灵敏度高、重复性好、特异性强,应用于2014年天津市手足口病监测,发现C VA6和CVA10已成为优势型病原体.

主 题 词：手足口病 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组10型 荧光定量RT-PCR 

学科分类：100208[100208] 1002[医学-临床医学类] 100202[100202] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2015.06.003

馆 藏 号：203890080...