利用CODEHOP设计简并引物克隆镰刀菌果胶酶基因片段

作     者：邹庆甲 王树桐 王娟 王亚南 胡同乐 曹克强 

作者机构：河北农业大学植物保护学院河北保定071001 

基　　金：农业部公益性行业(农业)科研专项(200903004-42) 国家现代苹果产业技术体系建设岗位专家专项(nycytx-08-04-01) 

出 版 物：《河北农业大学学报》 (Journal of Hebei Agricultural University)

年 卷 期：2012年第35卷第5期

页      码：57-62,93页

摘      要：利用CODEHOP(Consensus-degenerate hybrid oligonucleotide primers)设计真菌果胶酶基因片段的简并引物,并对设计的多对引物进行筛选,比较了普通PCR和Touchdown-PCR(TD-PCR)程序的扩增效果,并对产物进行了测序、比对和分析。结果表明:利用CODEHOP设计简并引物可信性强,阳性率高,能够从供试菌株中获得与目的片段大小相近的产物。利用TD-PCR程序扩增比普通PCR扩增效果好。扩增产物序列BLASTX比对和分析结果表明,产物片段编码的氨基酸序列与镰刀菌属来源的果胶酶氨基酸片段相似性均超过90%,说明所扩增的序列即为镰刀菌果胶酶基因片段。

主 题 词：简并引物 镰刀菌 果胶酶基因 降落PCR 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

馆 藏 号：203894095...