靶向柯萨奇病毒B3 siRNA的设计与筛选

作     者：代海丽 王艳 孙权 时连瑞 DAI Haili;WANG Yan;SUN Quan;SHI Lianrui

作者机构：山东英才学院医学院济南250101 

基　　金：山东省医药卫生科技发展计划项目(2018WS 210) 

出 版 物：《济宁医学院学报》 (Journal of Jining Medical University)

年 卷 期：2020年第43卷第1期

页      码：14-18页

摘      要：目的针对柯萨奇病毒B3(CVB3)基因筛选抑制效率较高的siRNA新序列,同时探究顺式作用复制元件(CRE)以外的2C区是否是设计siRNA序列的有效靶点。方法在CVB3的基因组中以3D、3C、2C、2A、VP3、VP2和VP1区为靶点设计新的siRNA序列,在He La细胞中转染siRNA序列,转染12h后,进行CVB3感染。感染病毒36h后收毒,用TCID50、MTT、Western blot和real-time RT-PCR 4种方法从不同水平上检测本研究设计筛选的siRNA序列在CVB3复制方面的抑制效果。结果设计的siRNA序列共11条,其中5条对CVB3的复制在细胞的死亡率、病毒的相关致病性、RNA分子水平和蛋白表达水平4个方面均表现出了较好抑制效果。其中siRNA-5对CVB3复制的抑制率达到了84%,本序列是针对2C区CRE以外的部分设计的。结论本文发现了5条新的抑制率较高的siRNA靶序列,同时首次证明CRE以外2C区也是设计siRNA序列的有效靶点。

主 题 词：柯萨奇B3病毒 RNA干扰 siRNA 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-9760.2020.01.004

馆 藏 号：203896121...