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西瓜细菌性果斑病菌的16S rDNA序列分析及特异性引物的设计

西瓜细菌性果斑病菌的16S rDNA序列分析及特异性引物的设计

作     者:张祥林 伍永明 王翀 李碧佳 ZHANG Xiang-lin;WU Yong-ming;WANG Chong;LI Bi-jia

作者机构:新疆出入境检验检疫局技术中心乌鲁木齐830052 新疆农业大学农学院乌鲁木齐830063 

基  金:国家质量监督检验检疫总局科研项目(2004IK-029) 

出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期:2007年第37卷第3期

页      码:225-231页

摘      要:利用细菌16S rDNA基因的通用引物对16个供试菌株进行PCR扩增,把扩增产物进行核苷酸序列测定。将获得的序列与GenBank中相关菌株的16S rDNA序列进行同源性分析。以此设计出检测A.a.c的特异性引物,并利用最大简约法构建了16S rDNA系统演化树。系统演化关系分析表明,6~9号供试菌株的16S rDNA序列与A.a.c标准菌株仅有3个位点的差异,其同源性均在99.8%以上,在构建的系统演化树上,它们聚为同一个族群。利用设计的一对特异性引物(BFB64/65),对各供试菌株进行PCR检测,结果只有A.a.c相关菌株产生扩增条带,产物大小与预期一致。

主 题 词:西瓜细菌陛果斑病菌(A.a.c) 16S rDNA 序列分析 系统发育 引物设计 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0412-0914.2007.03.001

馆 藏 号:203896914...

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