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云南省新发猪圆环病毒3型感染状况调查与全基因进化分析

云南省新发猪圆环病毒3型感染状况调查与全基因进化分析

作     者:曾彩虹 蓝睿 毕峻龙 陶鑫 孙显国 赵谦 杨贵树 尹革芬 ZENG Cai-hong;LAN Rui;BI Jun-long;TAO Xin;SUN Xian-guo;ZHAO Qian;YANG Gui-shu;YIN Ge-fen

作者机构:云南农业大学动物医学院昆明650201 楚雄州动物疫病预防控制中心楚雄675000 

基  金:云南省高校科技创新团队支持计划资助项目 

出 版 物:《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)

年 卷 期:2020年第28卷第2期

页      码:26-31页

摘      要:为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在云南省不同地区猪群中的流行情况,针对PCV3基因保守区域设计特异性引物,优化反应条件,建立PCR快速检测方法,并采用该方法对采自云南省不同地市431份样品进行检测,将获得的部分毒株全基因序列进行遗传进化分析。结果显示:本研究成功建立了一种快速、特异和灵敏的PCV3检测方法;云南省12个地(市)29县(区)中,8个地(市)12个县(区)检测出阳性样品;431份样品中有43份PCV3阳性样品,阳性率为9.98%;获得的3株PCV3全基因组序列与参考毒株之间的核苷酸同源性为98.6%~99.5%,进化树显示3株云南毒株形成一个小的进化分支,属于PCV3a基因型。本研究结果表明,PCV3在云南省多个地区呈一定的流行趋势,流行毒株以PCV3a基因型为主,有必要进一步开展云南地区PCV3流行病学调查,并提出防控对策。

主 题 词:猪圆环病毒3型 感染状况调查 基因进化分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

馆 藏 号:203898012...

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