甘薯羽状斑驳病毒海南分离物全基因组序列克隆及分析

作     者：李嘉莹 沈文涛 庹德财 朱国鹏 黎小瑛 言普 周鹏 Li Jiaying;Shen Wentao;Tuo Decai;Zhu Guopeng;Li Xiaoying;Yan Pu;Zhou Peng

作者机构：海南大学园艺学院海口570228 中国热带农业科学院热带生物技术研究所海南热带农业资源研究院海口571101 

基　　金：海南省重点研发计划(ZDYF2019030)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2020年第18卷第8期

页      码：2445-2451页

摘      要：为了明确海南本地甘薯羽状斑驳病毒(sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)种群的遗传进化关系及致病机理,本研究利用Small RNA测序技术对采自海南的甘薯样品进行鉴定,获得与SPFMV序列具有相似性的85个contigs,与NC_001841相似性较高。试验设计了5对共8条引物,分别为SPFMV-1F/1R、SPFMV-11F/1R、SPFMV-2F/2R、SPFMV-3F/3R和SPFMV-3F/33R PCR,扩增获得3987 bp、3710 bp、1996 bp、3369 bp和4730 bp目的片段。在此基础上再分段设计引物,进行基因全序列PCR扩增,序列拼接获得SPFMV-HN基因组全序列,其包含完整编码阅读框。本研究结果首次报道SPFMV海南分离物基因组全长,并且在P1区预测到另一个外框元件(pretty interesting sweet potato potyviral ORF,PISPO),聚合酶滑移机制可以产生带有额外核苷酸的转录变体,这些核苷酸可以翻译为P1N-PISPO和P3N-PIPO。本研究结果为进一步探究SPFMV致病分子机理和培育抗病甘薯品种奠定研究基础。

主 题 词：甘薯羽状斑驳病毒 Small RNA测序技术 全基因测序 序列分析 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.018.002445

馆 藏 号：203907654...