燕麦隐性核不育cSSR标记的开发及其验证

作     者：张丽君 刘龙龙 畅志坚 郭彬 崔林 ZHANG Li-Jun;LIU Long-Long;CHANG Zhi-Jian;GUO Bin;CUI Lin

作者机构：山西省农业科学院农作物品种资源研究所农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室山西太原030031 山西省农业科学院作物研究所山西太原030031 山西省晋中市寿阳县乡镇农产品质量安全监管站山西寿阳045400 

基　　金：山西省农科院博士基金项目(YBSJJ209) 山西省自然基金项目(2014011030-1) 山西省国际合作项目(2014081032-1) 国家燕麦荞麦产业技术体系(CARS-08-A-1)项目资助 

出 版 物：《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)

年 卷 期：2015年第24卷第7期

页      码：146-154页

摘      要：构建燕麦隐性核不育转录组数据库,开发cSSR标记,丰富燕麦分子标记数据库,并对隐性核不育相关cSSR标记进行验证,为充分利用燕麦种质资源及深入研究隐性核不育奠定基础。对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行转录组测序,利用软件对得到的EST序列进行SSR位点查找和分析,开发cSSR引物。并用CAMS1×品燕2号F2代群体对所开发的雄性不育相关的cSSR引物进行验证。通过转录组测序获得的EST序列中6409条存在SSR位点,736条序列中有2个及2个以上SSR位点;在所有SSR位点中三核苷酸、二核苷酸重复序列最多,分别为4340(56.66%)和1768(24.30%)个。三核苷酸重复中,CCG/CGG(26.68%)、AGG/CTT(21.29%)、AGC/CTG(18.48%)出现的频率较多,二核苷酸重复中,以AG/CT(60.63%)和AC/GT(26.24%)出现的频率较高;根据开发的cSSR设计了13344对cSSR引物,选择与雄性不育相关且能设计引物的21条序列合成45对SSR引物。PCR检测表明,32对引物(71%)有扩增产物,其中11对cSSR引物在亲本间的扩增产物具有多态性,7对引物在可育和不育性状池间存在差异。本研究对燕麦雄性不育近等基因系CAMS1进行了转录组测序,根据得到的EST序列开发了13344对cSSR引物,并利用CAMS1×品燕2号F2代群体进行有效性检测,32对引物有扩增产物,7个标记可用于燕麦雄性不育材料的分子检测。

主 题 词：燕麦 cSSR SSR标记 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.11686/cyxb2014232

馆 藏 号：203909535...