香菇SSR-PCR技术体系的优化及其在遗传多样性分析中的初步应用

作     者：肖扬 李黎 吴茜 边银丙 Xiao Yang;Li Li;Wu Qian;Bian Yinbing

作者机构：华中农业大学应用真菌研究所武汉430070 

基　　金：农业部公益性行业(农业)科研专项项目"食用菌菌种质量评价与菌种信息系统研究与建立"(nyhyzx07-008) 教育部农学教学实验用微生物菌种资源标准化整理 整合及共享试点(2005DKA21208-6) 

出 版 物：《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期：2009年第25卷第2期

页      码：20-24页

摘      要：为建立稳定的香菇SSR技术体系,采用L16(45)正交试验设计,对影响香菇SSR-PCR的主要因素进行了优化筛选,建立了最佳的反应体系。在20μl反应体系中,包含1.5mmol/LMg2+,75ng模板DNA,0.25mmol/L dNTPs,0.50μmol/L引物及1.5UTaq酶。梯度PCR试验筛选得到相应引物的最佳退火温度为62℃。以该体系为基础,应用5对引物扩增8个香菇菌株的基因组DNA,扩增条带清晰稳定,聚类分析结果能较好地反映供试菌株的地理来源关系。以0.5的相似性为分割点,8个菌株可分成2大类群。类群Ⅰ主要由北方菌株组成,类群Ⅱ由南方菌株组成。该研究为SSR标记技术在香菇分子生物学研究方面的应用奠定了基础。

主 题 词：香菇 SSR—PCR 正交设计 体系优化 聚类分析 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

馆 藏 号：203912290...