黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析

作     者：李威 赵姗 焦海峰 林志华 包永波 LI Wei;ZHAO Shan;JIAO Hai-feng;LIN Zhi-hua;BAO Yong-bo

作者机构：浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验浙江宁波315100 宁波市海洋与渔业研究院浙江宁波315100 

基　　金：宁波市农业科技攻关项目(2014C10018) 

出 版 物：《海洋科学》 (Marine Sciences)

年 卷 期：2015年第39卷第11期

页      码：61-67页

摘      要：以黄口荔枝螺转录组测序所得到的拼接序列为基础,利用MISA软件进行微卫星分析,利用Primer5.0设计引物160对。结果显示,83对引物能够成功扩增,引物在黄口荔枝螺渔山列岛群体多态性检测中发现,37个SSR位点能够表现出多态性,一共获得了129个等位基因,各位点等位基因数为2~5个,平均每个位点等位基因数为3.49个,观测杂合度H_o,期望杂合度H_e,多态信息含量PIC范围分别介于0.000~0.800、0.146~0.645、0.139~0.573之间,有9个表现为高度多态,20个表现为中度多态,8个表现为低度多态。实验结果进行Hardy-Weinberg平衡检测后,利用Bonferroni correction法进行校正,有29个位点显著偏离,结果表明渔山列岛黄口荔枝螺群体总体遗传多样性水平较低。

主 题 词：黄口荔枝螺 转录组 微卫星 遗传多样性 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.11759/hykx20150616002

馆 藏 号：203920915...