水稻microRNA1876功能验证与生物信息学分析

作     者：蔡俊 陈信波 Cai Jun;Chen Xinbo

作者机构：湖南农业大学作物基因工程湖南省重点实验室长沙410128 

基　　金：2011计划“南方粮油作物协同创新中心” 湖南省自然科学基金青年基金项目(2015JJ-3081) 湖南省研究生科研创新项目(CX2015B241)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2020年第18卷第7期

页      码：2102-2107页

摘      要：MicroRNA (miRNA)是一类由内源基因组转录的有基因调控功能的非编码短序列RNA,在动植物中参与转录后基因表达调控。为了研究Osa-miRNA1876基因功能,本研究对Osa-miRNA1876进行生物信息学分析,分析出启动子区间有与逆境相关的主要顺式作用元件ARE、GC-motif、GT1-motif、Sp1和LTR,并预测到了靶基因Os02t0476700-01。通过茎环法q RT-PCR,以水稻U6基因为内参基因,对Osa-miRNA1876在水稻分蘖期进行了相对定量。在水稻基因组中,克隆得到Osa-miRNA1876的前体基因,并根据Osa-miRNA1876序列设计了短串联靶标模拟物(short tandem target mimic, STTM)功能片段;将二者整合到植物表达载体pCAMIBA1390,分别获得了过表达载体pOsa-miRNA1876-OE和干扰载体pOsa-miRNA1876-STTM。用于后续的Osa-miRNA1876基因功能研究。

主 题 词：MicroRNA1876 生物信息学 qRT-PCR 短串联靶标模拟物 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.018.002102

馆 藏 号：203922934...