玉米叶向值的全基因组关联分析

作     者：彭勃 赵晓雷 王奕 袁文娅 李春辉 李永祥 张登峰 石云素 宋燕春 王天宇 黎裕 PENG Bo;ZHAO Xiao-Lei;WANG Yi;YUAN Wen-Ya;LI Chun-Hui;LI Yong-Xiang;ZHANG Deng-Feng;SHI Yun-Su;SONG Yan-Chun;WANG Tian-Yu;LI Yu

作者机构：天津市农作物研究所/天津市农作物遗传育种重点实验室天津300384 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 

基　　金：国家自然科学基金项目(31601308) 青年科研人员创新研究与实验项目(2018004) 天津市自然科学基金项目(19JCZDJC34500) 天津市农业科学院院长基金项目(17007)资助 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2020年第46卷第6期

页      码：819-831页

摘      要：叶向值是反映叶片"直"和"立"两个特性的综合指标。叶向值高的品种,叶片直而不弯,叶夹角小,有利于群体通风透光,在群体密度较高时比平展型更容易获得高产。阐明叶向值的遗传基础,对玉米理想株型分子设计育种具有重要的意义。本研究以285份多样性玉米自交系为材料,利用Illumina的maizeSNP50芯片基因分型结合连续2年的叶向值表型鉴定,通过全基因组关联分析方法挖掘玉米叶向值显著关联的SNP位点。方差分析表明,不同自交系的叶向值差异达到极显著水平(P<0.01)。在最优模型选择时,发现Q+K模型最适合本研究的叶向值关联分析。在2个年份下,共检测到15个与叶向值显著关联的位点(P<4.05E-5),包括27个SNP,解释5.54%~8.73%的表型变异,并挖掘了15个候选基因。其中1.07 bin上的位点2是本研究发现的重要位点,其候选基因可能是编码细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶的Zm00001d032050,有待进一步图位克隆工作验证。

主 题 词：玉米 叶向值 叶夹角 单核苷酸多态性 关联分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1006.2020.93063

馆 藏 号：203923021...