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泥鳅和黄鳝18S rRNA基因的克隆与序列分析

泥鳅和黄鳝18S rRNA基因的克隆与序列分析

作     者:张际峰 蒋磊 牛坤 汪承润 程滨 ZHANG Ji-feng;JIANG Lei;NIU Kun;WANG Cheng-run;CHENG Bin

作者机构:淮南师范学院生命科学系安徽淮南232001 

基  金:国家自然科学基金(批准号:20877032) 安徽省自然科学基金重点项目基金(批准号:KJ2008A137) 安徽省教育厅自然科学研究项目基金(批准号:KJ2009B268Z) 

出 版 物:《吉林大学学报(理学版)》 (Journal of Jilin University:Science Edition)

年 卷 期:2009年第47卷第4期

页      码:846-851页

摘      要:通过自行设计引物,扩增且测定了泥鳅和黄鳝18S rRNA基因部分序列,并讨论了后生动物18S rRNA基因的碱基含量变化情况.结果表明,泥鳅和黄鳝的18S rRNA基因部分序列长度均为1204 bp,泥鳅该基因序列GC含量为53.74%,黄鳝该基因序列GC skew为0.082,两条序列同源性为99.67%.将它们和大西洋鲑3个物种的18S rRNA基因与其线粒体12S rRNA,16S rRNA,Cytb和D-loop区4基因进行序列比较,发现核18S rRNA最保守,而线粒体D-loop区基因进化速率最快.从GenBank中选择已测定的4种鱼纲动物和11种脊索动物的同源序列,分别运用NJ法、MP和ML法,构建6种鱼纲动物和13种脊索动物的分子系统树,结果均显示,在鱼纲动物系统树中,6种鱼纲动物被分为软骨鱼类和硬骨鱼类两大支;在脊索动物的系统树中,鱼纲与脊椎动物的四足类形成姐妹群,表明它们在系统发育过程中具有同等重要地位.

主 题 词:泥鳅 黄鳝 18S rRNA基因 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1671-5489.2009.04.040

馆 藏 号:203925651...

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