油菜EST-SSR标记的建立

作     者：李小白 张明龙 崔海瑞 LI Xiao Bai;ZHANG Ming Long;CUI Hai Rui

作者机构：浙江大学原子核农业科学研究所杭州310029 

基　　金：农业部"结构调整重大技术研究专项"(04-05-03B) 

出 版 物：《分子细胞生物学报》 (Journal of Molecular Cell Biology)

年 卷 期：2007年第40卷第2期

页      码：137-144页

摘      要：在油菜17987条非冗余EST中,共发掘出了2083个EST-SSR,分布于2443条EST中,发生频率是13.58%,平均分布距离为4.34kb。在油菜EST-SSR中,二、三核苷酸重复是主要的重复类型,二者出现的频率相近,占总SSR的89.05%。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的84.31%和37.71%。进一步设计了23对SSR引物,通过梯度PCR试验确定了各引物的适宜退火温度,并利用非变性聚丙烯酰胺凝胶银染对这些引物在10个油菜品种中的扩增情况和多态性进行了检测。有21对引物显示扩增,引物可用率为91.30%;有12对引物显现出多态性,占可扩增引物的57.14%。本研究结果证明根据油菜EST建立SSR标记是有效、可行的。

主 题 词：油菜 EST SSR信息 标记建立 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1673-520X.2007.02.007

馆 藏 号：203932367...