基于Bioperl实现远程自动获取抗逆基因序列

作     者：张晓婧 潘伟民 曹兴芹 ZHANG Xiaojing;PAN Weimin;CAO Xingqin

作者机构：新疆师范大学生命科学学院新疆乌鲁木齐830054 

基　　金：自治区自然科学基金(2010211022) 新疆师范大学研究生科技创新基金(20131203)资助 

出 版 物：《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期：2014年第12卷第3期

页      码：185-188页

摘      要：BioPerl对于现今大量的生物数据来说,具有很好的获取和处理能力,并且NCBI提供了可以直接访问它下属的Entrez数据库(包括PubMed)的编程接口,即E-Utilities。为了从NCBI中自动获取大量抗逆基因序列,使得生物抗逆基因二次数据库得以搭建,该文基于BioPerl设计了远程自动获取大量抗逆基因序列的程序。此程序灵巧、精悍,Perl语言强大的文本处理功能使程序能实现不同类型基因序列的远程获取。

主 题 词：BioPerl E-Utilities 远程自动获取 抗逆基因 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-5565.2014.03.06

馆 藏 号：203935710...