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高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组

高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组

作     者:张天英 陈清瑞 杨炳春 陈仕海 袁权 葛胜祥 ZHANG Tian-ying;CHEN Qing-rui;YANG Bing-chun;CHEN Shi-hai;YUAN Quan;GE Sheng-xiang

作者机构:厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心福建厦门361005 

基  金:福建省自然科学杰出青年基金项目(2009J06020) 

出 版 物:《厦门大学学报(自然科学版)》 (Journal of Xiamen University:Natural Science)

年 卷 期:2011年第50卷第5期

页      码:947-950页

摘      要:探讨一种用于乙型肝炎病毒(HBV)基因组扩增的灵敏度高、广谱性好的巢式聚合酶链式反应(nested PCR)方法,适用于较低病毒拷贝数标本的HBVDNA扩增.通过设计两套通用巢式引物。实现对各基因型(A,B,C,D,E,G)HBV均具有较高的扩增效率;采用两步法分段扩增HBV基因组,对两段目的产物进行测序拼接获得HBV的全基因序列.应用本方法对4组病毒拷贝量(IU/mL)分别为:〉1.0×10^4,1.0×10^3~1.0×10^,2.0×10^2~1.0×10^3,〈2.0×10^2的100份血清标本进行全长基因组扩增,其中75份获得阳性结果,各组阳性率依次为:100%,66.7%,60%,25%.有效扩增灵敏度为2.0×10^2~1.0×10^3IU/mL;而一步法只在病毒拷贝量〉1.0×10^4 IU/mL的标本组中获得15份阳性结果,总的阳性率仅为15%,说明该方法扩增灵敏度明显高于一步法.因此。本方法为HBV流行病学调查研究HBV基因组序列提供了更高的灵敏度,可在流行病学调查中发挥重要作用.

主 题 词:乙型肝炎病毒 基因组 巢式聚合酶链式反应 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录:

馆 藏 号:203942264...

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