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屯昌猪PDK4基因克隆及其组织表达分析

屯昌猪PDK4基因克隆及其组织表达分析

作     者:孙瑞萍 王峰 晁哲 刘海隆 邢漫萍 刘圈炜 黄丽丽 郑心力 魏立民 SUN Ruiping;WANG Feng;CHAO Zhe;LIU Hailong;XING Manping;LIU Quanwei;HUANG Lili;ZHENG Xinli;WEI Limin

作者机构:海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南海口571100 海南省热带动物繁育与疫病控制重点实验室海南海口571100 

基  金:国家自然科学基金(31560628,31760646) 海南省省属科研院所技术开发研究专项(KYYS-2018-06) 中央引导地方科技发展专项资金(ZY2019HN01) 

出 版 物:《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期:2020年第32卷第6期

页      码:978-985页

摘      要:为获得屯昌猪丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因的编码序列(coding sequence,CDS)并分析其分子结构特征,研究屯昌猪、杜洛克猪及其杂交F1代不同组织中的PDK4基因表达水平,本研究以Genbank上公布的猪PDK4基因序列(登录号:NM_001159306)为参考设计引物,通过RT-PCR扩增、测序、拼接获得屯昌猪PDK4基因CDS区。结果显示:屯昌猪PDK4基因CDS区长度1224 bp,相对分子质量为46170.24 u,既没有跨膜结构也不存在信号肽,属于非分泌型蛋白,主要在线粒体中发挥作用,预测存在2个潜在的糖基化位点和33个磷酸化位点,α螺旋区域在预测的二级结构中占比最大。实时荧光定量PCR检测结果显示,PDK4基因在屯昌猪背最长肌中表达量最高,且极显著高于杜洛克猪及其杂交F1代猪。

主 题 词:屯昌猪 PDK4基因 克隆 组织表达 杜洛克猪 实时荧光定量PCR 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1004-1524.2020.06.05

馆 藏 号:203942310...

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