绵羊MC4R基因的半定量RT-PCR及生物信息学分析

作     者：张菊 杜立新 李宏滨 魏彩虹 ZHANG Ju;DU Li-xin;LI Hong-bin;WEI Cai-hong

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心北京100193 

基　　金：国家科技支撑计划项目-优质专用羊新品种选育(2006BAD01A11) 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2010年第41卷第7期

页      码：804-810页

摘      要：本研究旨在对绵羊MC4R基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考牛MC4R基因序列设计引物,采用PCR技术克隆绵羊MC4R基因序列,并利用半定量RT-PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆的绵羊MC4R基因全长1 919 bp,含有999 bp的完整CDS编码区,编码332个氨基酸。其CDS编码区的核苷酸序列与牛、人、猪、大鼠、小鼠MC4R基因对应序列的同源性分别为95.2%、68.8%、82.7%、76.6%、77.1%,预测的氨基酸序列同源性分别为97.0%、92.8%、93.7%、92.2%、91.6%。组织表达谱分析表明MC4R基因在各组织均不同程度的表达,其中在大脑表达量很高,其他组织较低。生物信息学预测MC4R蛋白功能发现,绵羊的MC4R蛋白存在7个跨膜螺旋结构域,同时预测MC4R存在10个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点。结果表明,MC4R是一个非常保守的蛋白,在绵羊的生长发育中起着重要作用。

主 题 词：黑素皮质素受体-4 基因克隆 半定量RT-PCR 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0836[0836] 090501[090501] 

核心收录：

馆 藏 号：203942344...