冠状病毒基因组资源库介绍

作     者：王庭璋 马云婷 沈泓 吴俊 李珏 李钧 孙宝昌 洪烨 洪文杰 王美霞 陈欢 俞云松 刘程智 

作者机构：浙江天科高新技术发展有限公司浙江省微生物技术与生物信息学研究重点实验室杭州310012 浙江省食品药品检验研究院国家药品监督管理局药品微生物检测与预警重点实验室杭州310052 杭州市临安区疾病预防控制中心卫生检验科311300 杭州市疾病预防控制中心卫生检验中心310021 温州市疾病预防控制中心微生物检验科浙江省325000 浙江大学医学院附属邵逸夫医院感染科浙江省微生物技术与生物信息学研究重点实验室杭州310016 

基　　金：浙江工业大学抗击新冠病毒(2019-nCoV)肺炎应急科研专项 

出 版 物：《中华传染病杂志》 (Chinese Journal of Infectious Diseases)

年 卷 期：2020年第38卷第5期

页      码：297-301页

摘      要：冠状病毒基因组资源库(Coronavirus Tracing,CoVTrac)是通过2019新型冠状病毒信息库(2019 novel coronavirus resource,2019nCoVR)、全球流行性感冒病毒数据库(Global Initiative on Sharing All Influenza Data,GISAID)和美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)等多个数据平台及自测方式收集冠状病毒基因组序列(包括2019新型冠状病毒),利用Java、Spring、Angular和MySQL等技术搭建的在线数据平台。CoVTrac数据库整合了包含α、β、γ、δ4个冠状病毒属共456条基因组序列,实现了数据提交、数据展示、进化溯源分析、基因功能注释和辅助分子实验设计等功能。CoVTrac数据平台可为包括新型冠状病毒在内的冠状病毒基因组的科学研究、流行病学调查和快速检测、药物研发等行业应用提供支持。

主 题 词：冠状病毒 多态性 单核苷酸 新型冠状病毒 进化 引物设计 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.cn311365-20200226-00142

馆 藏 号：203947032...