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用于HIV诊断的Oligo基因芯片研制

用于HIV诊断的Oligo基因芯片研制

作     者:温颖 马文丽 李凌 吴清华 徐秋林 张海燕 郑文岭 WEN Ying;MA Wen-li;LI Ling;WU Qing-hua;XU Qiu-lin;ZHANG Hai-yan;ZHENG Wen-ling

作者机构:南方医科大学基因工程研究所广东广州510515 广州军区总医院分子肿瘤学研究所广东广州510010 

基  金:国家自然科学基金(39880044) 广州市221重大科技项目(39880038) ~~ 

出 版 物:《第一军医大学学报》 (Journal of First Military Medical University)

年 卷 期:2005年第25卷第3期

页      码:293-297页

摘      要:目的研制快速筛查诊断HIV病毒的Oligo芯片。方法以HIV-1B亚型U26942全基因组序列为靶序列,利用DNA Club、Oligo 6.0、BLAST、Alignment等生物信息学软件,设计高度特异、长度均一、具近似熔解温度(Tm)的Oligo 探针,并制备成Oligo芯片。B(U26942)、C(U46016)、F(AF075703)、G(AF061640)四种亚型质粒分别经RD-梯度PCR与随机特异性引物PCR,经荧光标记后与芯片杂交,扫描芯片后进行统计学分析。结果与结论获得22条60 mer 探针,Oligo芯片特异性、敏感性及稳定性好,为进一步应用提供了条件。

主 题 词:HIV Oligo芯片 RD PCR 

学科分类:1010[医学-医学技术类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1673-4254.2005.03.013

馆 藏 号:203955672...

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