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三种七叶一枝花活性成分抗新型冠状病毒的分子对接预测

三种七叶一枝花活性成分抗新型冠状病毒的分子对接预测

作     者:司渊 王纠 张亮 刘雪文 刘莹 SI Yuan;WANG Jiu;ZHANG Liang;LIU Xue-wen;LIU Ying

作者机构:湖北医药学院基础医学院 湖北医药学院胚胎干细胞湖北省重点实验室 湖北医药学院武当特色中药研究湖北省重点实验室 湖北医药学院生物医药研究院十堰442000 

基  金:湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划(T201915) 武当特色中药研究湖北省重点实验室开放课题(WDCM2019008) 湖北医药学院PI项目(HBMUPI201806) 

出 版 物:《天然产物研究与开发》 (Natural Product Research and Development)

年 卷 期:2020年第32卷第7期

页      码:1099-1103页

摘      要:以分子对接法探索中草药七叶一枝花治疗新型冠状病毒SARS-CoV-2的活性化合物。SARS-CoV-2主要通过其S蛋白与人体细胞表面的Angiotensin-converting enzyme 2(ACE2)受体结合。本研究通过分子对接模拟预测了七叶一枝花中富含的3种重楼皂苷(Ⅰ、Ⅵ、Ⅶ)与ACE2的结合亲和力。结果表明:三种重楼皂苷均能够与ACE2结合,结合自由能均低于-8 kcal/mol。三种化合物共同结合的氨基酸残基包括:Pro-346、Thr-347、Ala-348、Asp-350、Asn-394、His-401、Glu-402。三种药物结合以上位点的结构主要是共同的母核结构起着关键作用。另外,重楼皂苷Ⅰ与ACE2结合所需能量最低,而重楼皂苷Ⅵ与靶蛋白作用的关键氨基酸数量最多及形成的氢键数量最多。因此,基于这三种有效成分进行结构设计有望获得高效的SARS-CoV-2抑制剂,以期为COVID-19治疗药物发现提供研究基础。

主 题 词:SARS-CoV-2 COVID-19 重楼皂苷 分子对接 

学科分类:100703[100703] 1007[医学-药学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.16333/j.1001-6880.2020.7.002

馆 藏 号:203955811...

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