基于全基因序列的中国北方3省(区)马铃薯Y病毒遗传多样性分析

作     者：马俊丰 李小宇 张春雨 周雪平 王永志 MA Junfeng;LI Xiaoyu;ZHANG Chunyu;ZHOU Xueping;WANG Yongzhi

作者机构：吉林省农业科学院植物保护研究所公主岭136100 中国农业科学院植物保护研究所北京100193 

基　　金：吉林省科学技术厅重点项目(20180201013NY) 国家重点研发计划(2017YFD0201604) 吉林省农业科技创新工程人才基金(C82230811) 

出 版 物：《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期：2020年第46卷第4期

页      码：40-47页

摘      要：本研究以马铃薯Y病毒(PVY)全基因组为基础,分析吉林、黑龙江和内蒙古3省(区)PVY群体遗传多样性和群体分化,并评估突变、重组、选择等遗传力所起的作用。根据已报道的PVY全基因序列保守区设计4对引物,采用片段重叠法对来自内蒙古和吉林的24个PVY分离物全基因序列进行测定,并联合NCBI中已登录的9个黑龙江分离物全基因组序列进行遗传多样性参数评估、群体分化检验和分子变异等分析。结果显示,我国北方3省(区)PVY群体遗传多样性高,其中内蒙古和黑龙江PVY群体遗传多样性高于吉林群体,并且3个群体之间呈现一定程度的遗传分化。分子变异分析发现在PVY基因组中存在1786个变异位点,表明我国北方3省(区)PVY群体变异程度较高,并且这种高变异度有85.54%来自各个马铃薯种植区内PVY个体的遗传变异。重组分析和系统发育分析发现,我国北方3省(区)PVY群体中重组株系占比高达90.3%,并具有明显的株系多样性,表明PVY重组株系已成为我国北方3省(区)马铃薯种植区的流行株系。选择压力分析显示,使用FEL和IFEL法分别检测出501个和315个净化压力选择位点,这表明3省(区)PVY群体受净化选择压力为主。以上结果表明,中国北方3省(区)PVY群体遗传多样性高,突变、重组和自然选择都对遗传多样性和群体分化存在一定影响。

主 题 词：马铃薯Y病毒(PVY) 遗传多样性 基因组序列 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

核心收录：

D　O　I：10.16688/j.zwbh.2019571

馆 藏 号：203956268...