火红熊蜂微卫星标记的筛选及种特异性分析

作     者：安建东 黄家兴 董捷 周冰峰 AN Jian-Dong;HUANG Jia-Xing;DONG Jie;ZHOU Bing-Feng

作者机构：福建农林大学蜂学学院福州350002 中国农业科学院蜜蜂研究所北京100093 

基　　金：国家自然科学基金项目(30800805,30901055,31072092) 国家“948”项目(2011-S1) 国家蜜蜂产业技术体系建设专项经费项目(CARS-45) 

出 版 物：《昆虫学报》 (Acta Entomologica Sinica)

年 卷 期：2011年第54卷第12期

页      码：1423-1432页

摘      要：火红熊蜂Bombus pyrosoma是中国特有的熊蜂资源,在华北地区分布十分丰富,是众多野生植物和农作物的重要传粉者。为了探究火红熊蜂的遗传结构及其进化关系,首次开展了该种熊蜂卫星标记的筛选及其种特异性研究。本研究采用生物素-磁珠吸附分离法从火红熊蜂基因组中筛选微卫星标记,并选取黑熊蜂亚属Melanobombus其他7种熊蜂进行了这些标记的种特异性验证。结果表明:不同探针与磁珠杂交产生的微卫星标记阳性克隆率存在很大差异,TC探针的微卫星阳性克隆率最高为82%;TG探针次之,为28%;AT和GC探针分离未获得微卫星标记克隆。根据获得的阳性克隆的序列设计引物进行筛选验证,共获得31对熊蜂微卫星序列特异性引物。微卫星标记分析发现,完美型(perfect)18个,占58.1%;非完美型(imperfect)10个,占32.3%;混合完美型(compoundperfect)1个,占3.2%;混合非完美型(compound imperfect)2个,占6.4%。不同探针的微卫星核心序列重复数不同,TC探针和TG探针的微卫星核心序列最高重复数分别为28和15个,最低重复数分别为7和11个。利用所获得的31对微卫星引物对黑熊蜂亚属其他7种熊蜂进行检测,有26对引物可以扩增所测试的7种熊蜂,其他5对引物只能扩增部分熊蜂种类,其中BPM5是火红熊蜂种特异性引物。本研究从火红熊蜂基因组中筛选的微卫星标记,不仅可用于火红熊蜂的遗传结构、分子进化和资源保护等方面的研究,而且可进一步用于黑熊蜂亚属其他种群的遗传特性分析。

主 题 词：熊蜂 火红熊蜂 分子标记 微卫星标记 磁珠富集 引物设计 种特异性 

学科分类：07[理学] 0713[0713] 

核心收录：

D　O　I：10.16380/j.kcxb.2011.12.014

馆 藏 号：203956513...