Mtb_G5K同源建模及其与[3,2-c]喹啉对接研究

作     者：刘鸿仪 杨敏 陈依帆 贺子豪 张松杰 徐永涛 LIU Hong-yi;YANG Min;CHEN Yi-fan;HE Zi-hao;ZHANG Song-jie;XU Yong-tao

作者机构：新乡医学院生物医学工程学院河南新乡453000 新乡市生物医学信息研究重点实验室河南新乡453000 临床与生物医学大数据融合技术河南省工程实验室河南新乡453000 

基　　金：国家自然科学基金项目(21603180)资助 新乡医学院科研启动经费(505060,505144)资助 新乡医学院研究生创新课题支持项目(YJSCX201917Z)资助 

出 版 物：《化学研究与应用》 (Chemical Research and Application)

年 卷 期：2020年第32卷第7期

页      码：1200-1206页

摘      要：结核病一直困扰着人类的健康。谷氨酸5-激酶(G5K,Glutamate 5-Kinase)作为新型抗结核药物靶标,小分子活化剂与其结合后,激活生物合成途径,会产生过量的脯氨酸和活性氧,从而杀死结核分枝杆菌(Mtb)。本文基于结核分枝杆菌谷氨酸5-激酶(Mtb_G5K)的一级序列,采用同源模建的方法构建Mtb_G5K蛋白三维结构并对其优化,运用三种方法分别对模型的各个方面进行评估,从而得到合理的蛋白质三维模型;构建小分子并将其能量最小化获得药物分子的最低能量构象,用Autodock将小分子对接到Mtb_G5K的活性位点;分析探讨[3,2-c]喹啉类小分子结合模式,观察蛋白与小分子之间的相互作用并预测具有稳定结合的高活性药物,从而推断出喹啉环的取代基采用相对分子质量较大的官能团能够增强药物小分子的酶催化活性。本研究结果对将来抗结核小分子的研发设计提供了新的思路。

主 题 词：结核分枝杆菌 谷氨酸激酶 活化剂 同源建模 分子对接 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

馆 藏 号：203956562...