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运用TRAP标记分析5个鲤群体的遗传多样性

运用TRAP标记分析5个鲤群体的遗传多样性

作     者:董在杰 曲疆奇 苏胜彦 梁政远 明俊超 袁新华 谢庄 DONG Zai-jie;QU Jiang-qi;SU Sheng-yan;LIANG Zheng-yuan;MING Jun-chao;YUAN Xin-hua;XIE Zhuang

作者机构:南京农业大学动物科技学院江苏南京210095 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 

基  金:现代农业产业技术体系建设专项资金项目(nycytx-49) 国家“十一五”科技支撑计划项目专题(2006BAD01A1208) 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放课题(BZ2009-06) 

出 版 物:《上海海洋大学学报》 (Journal of Shanghai Ocean University)

年 卷 期:2011年第20卷第2期

页      码:179-184页

摘      要:运用TRAP标记技术,选取10个多态性较好的引物组合对荷包红鲤、黄河鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等5个鲤群体进行遗传多样性分析,其中固定引物是根据目标候选基因GHR基因的序列设计。结果表明,共扩增出168个位点,其中多态性位点134个,平均多态位点比例为80.41%,平均多态性信息含量为0.29。分子变异方差分析(AMOVA)结果显示群体内的方差贡献率达96.97%,表明各个鲤群体内存在较大的遗传变异。种群再分效应固定指数(FST=0.030 26,P<0.05)表明不同鲤群体间有显著的遗传分化。基于目标候选基因的TRAP标记对5个鲤群体进行聚类分析,结果表明建鲤和兴国红鲤首先聚成一类,然后黄河鲤和黑龙江野鲤聚为一类,再与荷包红鲤聚为一类。

主 题 词: TRAP标记 遗传多样性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0908[0908] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 090501[090501] 

馆 藏 号:203957223...

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