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紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

作     者:肖国辉 王弋 娄永峰 林新春 郭小勤 方伟 XIAO Guohui;WANG Yi;LOU Yongfeng;LIN Xinchun;GUO Xiaoqin;FANG Wei

作者机构:浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地浙江临安311300 

基  金:浙江省科学技术攻关项目(2007C22081) 浙江农林大学科研发展基金面上资助项目(2007FR025) 

出 版 物:《浙江农林大学学报》 (Journal of Zhejiang A&F University)

年 卷 期:2013年第30卷第4期

页      码:511-516页

摘      要:根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计1对引物,分别从紫竹Phyl-lostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示:9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型,一年紫和沟槽紫,该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性(SNP)位点,多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。

主 题 词:植物学 紫竹 PPO基因 单核苷酸多态性(SNP) 遗传多样性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 

馆 藏 号:203965714...

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