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表面活性剂辅助蛋白质体外折叠:分子模拟

表面活性剂辅助蛋白质体外折叠:分子模拟

作     者:卢滇楠 王君 刘志霞 张敏莲 刘铮 LU Diannan;WANG Jun;Liu Zhixia;ZHANG Minlian;LIU Zheng

作者机构:清华大学化学工程系北京100084 

基  金:国家自然科学基金项目(20376041) 国家重点基础研究发展规划项目(2003CB716004).~~ 

出 版 物:《化工学报》 (CIESC Journal)

年 卷 期:2005年第56卷第6期

页      码:1063-1069页

摘      要:采用分子模拟方法考察表面活性剂与蛋白质分子之间的相互作用及其对蛋白质折叠过程热力学特性的影响,蛋白质分子构建采用HP模型并引入了方阱类势函数.模拟结果显示:模型蛋白分子的某些折叠中间态会陷入局部能量最低状态而无法完成折叠;弱疏水性表面活性剂对模型蛋白的稳定性影响小,但可有效地帮助处于局部能量最低状态的蛋白折叠中间态通过能量壁垒而实现折叠;强疏水性表面活性剂则可与蛋白质形成高稳定性的复合物而阻止折叠的进行,需将其脱除才能使折叠过程重新开始.模拟结果还显示:表面活性剂的加入会使蛋白质折叠中间态更加丰富,从而能够光滑折叠过程中的能量阱;表面活性剂与变性环境对于蛋白质的折叠具有协同效应.模拟结果与文献报道的实验结果具有一致性,显示分子模拟的方法在揭示蛋白质折叠过程的微观机理以及表面活性剂类折叠助剂的分子设计方面有很好的应用前景.

主 题 词:分子模拟 HP模型 表面活性剂 折叠中间态 动态MonteCarlo模拟 蛋白质体外折叠 

学科分类:0832[0832] 081704[081704] 07[理学] 0817[工学-轻工类] 08[工学] 070303[070303] 0703[理学-化学类] 083202[083202] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0438-1157.2005.06.019

馆 藏 号:203971402...

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