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甲硫氨酸-脑啡肽的分子动力学模拟

甲硫氨酸-脑啡肽的分子动力学模拟

作     者:计明娟 叶学其 杨鹏程 Ji Mingjuan;Ye Xueqi;Yang Pengcheng

作者机构:中国科学技术大学研究生院北京100039 

基  金:中国科学院所长择优基金 

出 版 物:《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期:1999年第15卷第11期

页      码:1011-1016页

摘      要:用高温淬火分子动力学模拟方法研究了甲硫氨酸脑啡肽(Metenkephalin)在真空中的构象性质.经聚类分析和能量优化得到了十三个低能构象,并与吗啡进行了空间拟合.模拟结果表明,Metenkephalin是一种构象柔性大的多肽分子,可具有多种构象,主要为Gly2-Gly3和Gly3-Phe4之间的β折叠型式.大多数的结构具有由氢键连接两个末端残基所形成的假大环,侧链和芳香环定位在假大环的同侧.模拟结果还表明,模型最大的特征是:酪氨酸残基中的氨基N相当于吗啡中哌啶环上的季胺N,酪氨酸残基中的酚环相当于吗啡中的酚环,苯丙氨酸残基中的芳香环相当于吗啡中环己烯环.此肽与吗啡在空间结构(药效基团)上非常相似,都满足阿片受体的要求.所以,它们可作用于同一受体.该模型也能为具有阿片效能的肽和非肽配体的药效团设计提供帮助.

主 题 词:甲硫氨酸脑啡肽 分子动力学 模拟 药效团 脑啡肽 

学科分类:1007[医学-药学类] 0703[理学-化学类] 0702[理学-物理学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3866/pku.whxb19991111

馆 藏 号:203980047...

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