猪流感病毒H3N2亚型济南株HA、NA、NP基因的克隆与序列分析

作     者：朱晓林 凌宗帅 邱莹 谢之景 赵宏坤 姜世金 张兴晓 ZHU Xiao-lin;LING Zong-shuai;QIU Ying;XIE Zhi-jing;ZHAO Hong-kun;JIANG Shi-jin;ZHANG Xing-xiao

作者机构：山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 济南出入境检验检疫局山东济南250000 

基　　金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(2008BS07017) 山东出入境检验检疫局科研基金资助项目(SK03-2004) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2010年第30卷第8期

页      码：1060-1063,1106页

摘      要：根据GenBank中流感病毒H3N2亚型HA、NA、NP基因序列,分别设计扩增HA、NA、NP基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒（SIV）H3N2济南株（SW/SD/JT/07（H3N2））HA、NA、NP基因,分别将RT-PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果显示,SW/SD/JT/07（H3N2）HA基因长度约为1 701 bp,编码566个氨基酸,与参考毒株的同源性为65.2%~81.8%;HA0切割位点序列为PENQTR↓G,属非高致病性毒株;SW/SD/JT/07（H3N2）HA蛋白有7个糖基化位点,由于碱基突变缺少了1个糖基化位点,表明其抗原性及其生物学特性发生变化。SW/SD/JT/07（H3N2）与所有参考毒株HA蛋白上的受体结合位点的氨基酸很保守,即98、134、136、138、226位分别为Tyr、Gly、Ser、Ala、Asn。SW/SD/JT/07（H3N2）NA基因长为1 413 bp,编码470个氨基酸,与参考毒株的同源性为65.1%~91.8%,NA基因系统发生分析表明SW/SD/JT/07（H3N2）与禽流感病毒H3N2亚型亲缘关系最近。SW/SD/JT/07NA（H3N2）NA蛋白与参考毒株的颈区63、64、65位置均无氨基酸缺失现象,可推测其对病毒的复制能力不会有很大影响。SW/SD/JT/07（H3N2）NP基因长为1 565 bp,编码498个氨基酸。与参考毒株的同源性为79.8%~87.8%,NP基因系统发生树分析结果表明,2002年、2004年暴发的西班牙流感同源性较高,亲缘关系较近,而与中国内地广东株同源性小,亲缘关系较远。

主 题 词：猪流感病毒 HA基因 NA基因 NP基因 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2010.08.021

馆 藏 号：203989078...