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泡状棘球蚴骨桥蛋白基因克隆及其生物学分析

泡状棘球蚴骨桥蛋白基因克隆及其生物学分析

作     者:杨照辉 杨海成 张宏伟 张龙 史康杰 温钰鹏 张永国 褚志强 陈骞 杨婧 赵梅凤 刘诗文 张示杰 YANG Zhao-hui;YANG Hai-cheng;ZHANG Hong-wei;ZHANG Long;SHI Kang-jie;WEN Yu-peng;ZHANG Yong-guo;CHU Zhi-qiang;CHEN Qian;YANG Jing;ZHAMei-feng;LIU Shi-wen;ZHANG Shi-jie

作者机构:石河子大学医学院第一附属医院肝胆外科石河子832000 

基  金:国家自然科学基金(81760569) 

出 版 物:《医学研究生学报》 (Journal of Medical Postgraduates)

年 卷 期:2020年第33卷第10期

页      码:1033-1038页

摘      要:目的骨桥蛋白(OPN)在肿瘤的迁徙和转移中发挥重要作用,但目前泡状棘球蚴在宿主体内迁徙和转移机制尚不明确。文中旨在扩增多房棘球绦虫OPN全长基因序列并进行其生物学分析。方法提取泡球蚴原头节总RNA,逆转录成cDNA,从基因数据库中通过BLAST找到可能的OPN基因保守序列片段设计引物,PCR扩增目的基因测序并鉴定其为同源性片段,然后应用RACE方法对该目的基因进行扩增。对得到的泡球蚴OPN全长基因序列进行功能和结构分析。结果泡球蚴OPN cDNA全长1390 bp。相对分子质量为50 363.75,理论等电点(pl)为11.18,其中含有411个腺嘌呤、297个胞嘧啶、334个鸟嘌呤、348个胸腺嘧啶。ORF长度为849 bp,编码641个氨基酸,始于96 bp,止于944 bp。二级结构预测α-螺旋(h)占20.81%,β-折叠(e)占15.26%,β-转角(t)占10.08%,无规则卷曲(c)占53.85%。结论成功克隆了泡球蚴OPN基因并研究分析其序列及蛋白,为其功能研究奠定了基础。

主 题 词:多房棘球绦虫 骨桥蛋白 生物信息学 

学科分类:1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D O I:10.16571/j.cnki.1008-8199.2020.10.005

馆 藏 号:203990775...

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