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杜贝病毒、盖勒尤卜病毒、蒂亚福拉病毒等三种内罗病毒实时荧光RT-PCR检测方法研究

杜贝病毒、盖勒尤卜病毒、蒂亚福拉病毒等三种内罗病毒实时荧光RT-PCR检测方法研究

作     者:杜珊珊 赖丽金 李阿茜 黄晓霞 王芹 李川 梁米芳 李德新 李建东 Du Shanshan;Lai Lijin;Li Aqian;Huang Xiaoxia;Wang Qin;Li Chuan;Liang Mifang;Li Dexin;Li Jiandong

作者机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 

基  金:国家科技重大专项题目:病毒感染高通量快速检测与应急筛检技术研究(2018ZX10711001) "一带一路"重要传染病流行规律和预警应对技术研究(2018ZX10101-002) 非洲病毒性出血热实验室检测及血清流行病学调查研究(2016ZX10004222-002) 

出 版 物:《国际病毒学杂志》 (International Journal of Virology)

年 卷 期:2020年第27卷第5期

页      码:412-416页

摘      要:目的建立可检测杜贝病毒(dugbe virus,DUGV)、盖勒尤卜病毒(qalyub virus,QALV)和蒂亚福拉病毒(thiafora virus,TFAV)等三种内罗病毒基因组的实时荧光RT-PCR检测方法。方法收集、整理,比对、分析在公共数据库发布的三种病毒基因组S节段核苷酸序列,确定检测靶标,利用生物信息软件设计特异性引物、探针,优化检测程序,建立实时荧光定量RT-PCR检测方法,利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果所建实时荧光定量RT-PCR检测方法均可有效扩增检测病毒靶标RNA,检测限分别为160 copies/μL,20 copies/μL和10 copies/μL,检测科萨努尔森林病病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增,三种内罗病毒相互间无交叉反应,重复性分析显示变异系数均在2%以内。结论本研究建立的检测DUGV、QALV和TFAV的实时荧光RT-PCR方法,可用于相关临床样本、媒介、宿主动物标本以及进出口物品筛查检测。

主 题 词:内罗病毒 杜贝病毒 盖勒尤卜病毒 蒂亚福拉病毒 实时荧光RT-PCR 

学科分类:100208[100208] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 1002[医学-临床医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D O I:10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2020.05.014

馆 藏 号:203991976...

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