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龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建

龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建

作     者:李浩然 丁峰 张树伟 彭宏祥 潘介春 何新华 王颖 李琳 王金英 黄幸 谭春露 徐炯志 LI Haoran;DING Feng;ZHANG Shuwei;PENG Hongxiang;PAN Jiechun;HE Xinhua;WANG Ying;LI Lin;WANG Jinying;HUANG Xing;TAN Chunlu;XU Jiongzhi

作者机构:广西壮族自治区农业科学院/广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西南宁530007 广西大学农学院广西南宁530004 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室广西南宁530004 广西壮族自治区农业科学院园艺研究所广西南宁530007 

基  金:国家荔枝龙眼产业技术体系建设专项(CARS-33-10),国家荔枝龙眼产业技术体系良种繁育与生产配套技术岗位(CARS-32-04) 国家现代农业产业技术体系广西荔枝龙眼创新团队项目(nycytxgxcxtd-02) 

出 版 物:《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期:2020年第35卷第9期

页      码:929-936页

摘      要:【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析,同时构建超表达载体。【结果】MYB14基因属于MYB-related家族的TBP-like亚家族,ORF长度831 bp,编码276个氨基酸,有一个MYB结合位点。该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞质,存在57个氨基酸磷酸化位点。其二级结构主要由无规则卷曲以及α-螺旋构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明该基因与大麻亲缘关系最近,同时成功构建了植物超表达载体pBI121-MYB14。【结论】本研究克隆得到了龙眼MYB14基因,成功构建表达载体pBI121-MYB14,为该基因功能的研究奠定了坚实的基础。

主 题 词:龙眼 MYB-related 基因克隆 表达载体构建 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.19303/j.issn.1008-0384.2020.09.002

馆 藏 号:203992122...

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