中国大陆手足口病相关的肠道病毒71型基因特征分析

作     者：孙海燕 崔大伟 Sun Haiyan;Cui Dawei

作者机构：浙江省绍兴第二医院检验科312000 浙江大学医学院附属第一医院输血科杭州310003 

基　　金：国家自然科学基金(81871709) 

出 版 物：《中华临床感染病杂志》 (Chinese Journal of Clinical Infectious Diseases)

年 卷 期：2020年第13卷第5期

页      码：353-358页

摘      要：目的了解中国大陆肠道病毒71型(EV71)VP1区基因特征和基因亚型,为更好地预防和控制儿童感染EV71型手足口病提供参考。方法在GenBank检索并下载中国大陆1996至2018年全部EV71病毒株(除去重复序列,共计3 102株)及已知EV71基因亚型参考株(30株)的VP1基因序列,使用MEGA 6.0软件进行比对分析和构建种系进化树,分析VP1蛋白氨基酸同源性、遗传变异情况和基因亚型。结果 3 102株分离株(不包括参考株)的同源性为88.33%~100.00%,包括参考株的同源性为87.34%~100.00%,与疫苗株H07的氨基酸同源性为93.47%~100.00%,与疫苗株FY7VP5及FY-23K-B的氨基酸同源性均为93.04%~100.00%。2000年起,EV71的流行株以C4亚型为主,2005至2018年以C4a亚型为主,C4b亚型次之,其他亚型散在出现。EV71的VP1区部分氨基酸变异频率较高,包括A293S(16.75%)、S283T(15.73%)、A289T(12.44%)、E98K(7.22%)、H22Q(6.66%)、N31D(4.50%)和V249I(4.40%)。结论中国大陆EV71分离株与疫苗株C4a亚型相匹配,疫苗基本能有效控制中国大陆EV71感染。持续监测EV71的遗传特征对于预防和控制儿童的EV71型手足口病及疫苗的设计至关重要。

主 题 词：肠道病毒EV71 VP1 基因特征 遗传变异 基因亚型 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100202[100202] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1674-2397.2020.05.006

馆 藏 号：203992808...