甘蓝型油菜BnaWRKY30-like基因cDNA序列克隆及生物信息学分析

作     者：尹明智 胡燕 YIN Mingzhi;HU Yan

作者机构：遵义师范学院生物与农业科技学院遵义563006 

基　　金：贵州省科学技术厅、遵义市科学技术局、遵义师范学院联合科技基金资助(黔科合LH字7016号) 贵州省高层次创新型人才培养计划项目(遵市科合人才11号) 遵义师范学院2017年学术新苗培养及创新探索项目培育项目(黔科合平台人才[2017年]5727-15号)共同资助 

出 版 物：《安徽农业大学学报》 (Journal of Anhui Agricultural University)

年 卷 期：2020年第47卷第5期

页      码：832-838页

摘      要：WRKY转录因子是植物所特有的一个超级基因家族,能调控植物生长发育过程及逆境反应。根据转录组测序获得的EST序列设计引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆了甘蓝型油菜WRKY30基因cDNA全长序列,并运用生物信息学手段对序列进行了分析及预测。结果表明:BnaWRKY30-like基因全长cDNA序列中包含102 bp的5′-UTR序列,188 bp的3′-UTR序列以及942 bp的完整ORF,编码313个氨基酸。该转录因子蛋白相对分子量为35319.85D,等电点为6.22,基本氨基酸中含量最高的丝氨酸(Ser),313个氨基酸中含有41个酸性氨基酸,34个碱性氨基酸,在121~182区域含有一个典型的WRKY结构域。亚细胞定位预测发现该转录因子定位于细胞核的可能性最高。蛋白质的二级结构预测表明共有α-螺旋占26.20%,延伸链占10.54%,β-转角占4.47%,无规则卷曲占58.79%。BnaWRKY30-like基因编码的蛋白具有典型的WRKY转录因子特征,与拟南芥WRKY30基因亲缘关系近,可能在油菜早期生长发育过程及盐胁迫中的发挥调控作用。

主 题 词：甘蓝型油菜 WRKY转录因子 基因克隆 RACE技术 生物信息学分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.13610/j.cnki.1672-352x.20201113.022

馆 藏 号：203992843...