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沈阳花生上菜豆普通花叶病毒的鉴定与全序列分析

沈阳花生上菜豆普通花叶病毒的鉴定与全序列分析

作     者:王筠竹 杨彩霞 于美春 侯秋实 WANG Junzhu;YANG Caixia;YU Meichun;HOU Qiushi

作者机构:沈阳大学辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室辽宁沈阳110044 

基  金:辽宁省自然科学基金资助项目(20180550863) 辽宁省教育厅一般项目(L2015362) 

出 版 物:《沈阳大学学报(自然科学版)》 (Journal of Shenyang University:Natural Science)

年 卷 期:2020年第32卷第6期

页      码:464-470页

摘      要:2017年9月在辽宁沈阳采集到表现明显斑驳褪绿症状的花生样品,怀疑为植物病毒侵染所致.透射电镜负染色观察到约15 nm×800 nm的线性病毒粒子.选取明显病症样品进行转录组测序,原始数据经过滤拼接后进行同源搜索,显示该病毒与菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)高度同源.基于转录组结果,设计6对特异引物扩增BCMV全基因组,确定其全长为10076bp核苷酸(MN786956).基于外壳蛋白基因(coat protein,CP)进行同源性比对,结果显示,其与BCMV中国武汉大豆分离物(BCMV-[CN:WH:Glycine max],KJ807813)的核苷酸同源性为99.4%,氨基酸同源性为99.7%.系统发育分析显示它聚类在BCMV花生分离物的分支上.这是辽宁地区有关BCMV自然侵染花生的首次报道.

主 题 词:花生 菜豆普通花叶病毒 转录组测序 分子鉴定 序列分析 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

D O I:10.16103/j.cnki.21-1583/n.2020.06.004

馆 藏 号:203995425...

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