摘要：基于MRI图像对直肠癌肿瘤进行分割与T分期识别在直肠癌术前诊断与治疗方案制定中起着重要作用。为了准确分割肿瘤并进行T分期,提出一种多任务学习模型DPU-Net,联合分割与分期任务。在分割分支中,针对直肠癌MRI图像结构复杂的特点,结合注意力机制与多尺度特征加强模型对肿瘤的关注度以及边缘特征提取能力,提高分割效果。在分类分支中,为解决直肠癌肿瘤T分期难的问题,引入诊疗文本,充分利用医疗数据。提出基于动态加权的多模态融合模型,结合图像特征与文本特征对肿瘤T分期识别。将本文模型与主流模型进行对比,实验结果表明,本文模型分割精度DSC为82.88%,相比于U-Net提升了17.96%。分类准确率为76.24%,相比于Dense-Net提高了9.43%。本文模型具备辅助医生诊断的可行性。

摘要：目的探讨胃癌组织中环状RNA矮小相关转录因子1(circRUNX1)的表达及其与临床病理特征和患者预后的关系。方法收集上海交通大学附属第一人民医院胃肠外科2015年4月至2018年12月接受首次胃癌根治术的35例胃癌患者的胃癌组织(研究组)及癌旁正常组织(对照组),利用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测组织中circRUNX1表达水平。分析circRUNX1的表达水平与胃癌患者临床病理特征及患者预后的关系。统计学方法采用χ^2检验和Kaplan-Meier法结合Log-rank检验进行。结果结合circRNA测序结果和RT-qPCR验证,发现胃癌组织中circRUNX1的表达水平高于癌旁正常组织(68.6%,24比11)。进一步分析发现胃癌组织中circRUNX1的表达水平与肿瘤大小(χ^2=5.844,P<0.05)、淋巴结转移(χ^2=6.496,P<0.05)及肿瘤病理分期(TNM分期)(χ^2=8.426,P<0.05)显著相关。Kaplan-Meier分析结果显示,circRUNX1高表达的胃癌患者的总生存率低于circRUNX1低表达者(Log-rank=11.010,P<0.05),差异有统计学意义。结论circRUNX1在胃癌组织中高表达,与胃癌的临床病理特征和患者预后密切相关,可能成为一个潜在的胃癌预后新指标。

摘要：目的·通过分析结直肠癌组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的差异表达谱,揭示结直肠癌的发生机制及差异表达circRNA与结直肠癌患者预后之间的关系。方法·收集上海交通大学附属第一人民医院普外科行结直肠癌根治术12例患者的肿瘤与癌旁正常组织,使用高通量测序技术检测结直肠癌及癌旁组织中circRNA的表达情况。通过基因本体(gene ontology,GO)注释分析及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,对差异表达的circRNA进行功能预测。在显著表达上调与下调的circRNA中各挑选2个circRNA,采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,RTqPCR)技术在44对结直肠癌组织中验证测序结果的准确性,通过搜索公共数据库构建这4种circRNA与微RNA(microRNA,miRNA)特异性结合网络图。最后结合患者预后资料判断差异表达circRNA与预后的关系。结果·经高通量测序共检测出20924个circRNA。与癌旁正常组织比较在结直肠癌组织中异常显著表达的circRNA共有373个(︱log2FC︱>1,P<0.05),其中显著上调的有243个,显著下调的有130个。在44对结直肠癌样本中,RT-qPCR验证结果与高通量测序数据筛选的circRNA表达趋势基本一致。通过绘制circRNA-miRNA-mRNA互作网络后发现,与circRNA相关的miRNA与mRNA在结直肠癌患病过程中可能起着关键作用。结合患者预后信息,hsa_circ_0023984、hsa_circ_0008192高表达的患者预后较差;hsa_circ_0020093、hsa_circ_0069922高表达的患者预后较好。结论·结直肠癌组织中存在异常表达的circRNA,这对进一步研究circRNA在结直肠癌发生和发展中的作用机制奠定了基础,对未来新型临床诊断标志物及治疗的发展提供有价值信息。