摘要：中医作为中华民族五千多年文明的瑰宝,积累了大量宝贵的医学文献。其中,《伤寒论》作为中医四大经典之一,在中医临床诊断与治疗方面具有深远的影响。研究旨在通过构建基于《伤寒论》的中医BIO标注数据集,探索自然语言处理(Natural Language Processing,NLP)在中医命名实体识别中的作用。文章使用了四种主流的序列标注模型,分别是隐马尔可夫模型(Hidden Markov Model,HMM)、条件随机场(Conditional Random Field,CRF)、双向长短期记忆网络(Bi-directional Long Short-Term Memory,Bi LSTM)和结合CRF的Bi LSTM(Bi LSTM+CRF),并对这些模型在中医命名实体识别(Named Entity Recognition,NER)中的性能进行了系统对比。

摘要：为从东北地区腹泻仔猪粪便样品中分离猪萨佩罗病毒(PSV)流行株,本研究采集2020年~2022年东北地区不同猪场仔猪腹泻粪便样品,首先利用PSV特异性的RT-PCR方法对临床样品初步检测,将RT-PCR检测为PSV阳性样品接种PK-15细胞进行病毒分离并传至30代,然后将第30代病毒经PCR和间接免疫荧光试验(IFA)鉴定,采用Reed-Muench法测30代分离病毒的TCID50及全基因组序列分析,最后将分离病毒经口服5 mL(10^(7.386)TCID_(50)/0.1 mL)感染3日龄仔猪进行致病性分析。结果显示,在采集的95份样品中有17份样品在624 bp左右出现目的条带,将PSV阳性粪便样品接种PK-15细胞,结果有1份样品于接种后24 h细胞出现变圆、皱缩和脱落等PSV特征性细胞病变,表明分离到1株PSV,将其命名为HLJ 2204株;病毒蚀斑纯化后的30代病毒效价为107.386TCID50/0.1 mL;HLJ 2204株基因组全长7306 bp,同源性分析结果显示其与GenBank中PSV基因组核苷酸的相似性为84.3%~91.5%,系统发育树结果显示,HLJ 2204株与上海流行株SHCM2019处于同一分支,亲缘关系最近。HLJ 2204株经口服感染3日龄仔猪进行致病性研究,结果发现仔猪感染后24 h出现腹泻、体重减轻、精神亢奋等症状,肠道、肺脏以及脑组织出现不同程度的剖检病变,肠黏膜上皮细胞脱落,黏膜下层明显水肿;脑组织神经元变形、神经细胞空泡化、神经纤突变短。感染组仔猪在感染后4 d粪便病毒载量最高,病毒主要分布在肠道组织。综上,本实验成功分离获得了PSV HLJ 2204株,并分析了其全基因组序列特征及致病性,对深入了解黑龙江地区猪病毒性腹泻的流行及防控具有重要意义,并进一步丰富了PSV病毒库,为开发设计新型疫苗奠定了基础。