摘要：目的建立一种汉滩病毒(Hantaan virus,HTNV)和汉城病毒(Seoul virus,SEOV)双重实时定量荧光RT-PCR检测方法。方法根据HTNV和SEOV S基因设计引物和探针、优化反应条件,建立2种汉坦病毒的双重实时荧光定量RT-PCR方法。以甲型流感病毒、登革热病毒、新布尼亚病毒、寨卡病毒、新冠病毒阳性核酸为模板验证方法的特异性,将建立的方法与巢氏RT-PCR比较,确定方法对临床样本的适用性。结果建立了一种HTNV和SEOV双重实时定量荧光RT-PCR检测方法,该方法对2种型别病毒的最低检测限均为10 copies/μL,不同浓度标准品Ct值批内和批间差异均小于2%。与登革热病毒、新布尼亚病毒、寨卡病毒、新型冠状病毒、甲型流感病毒均无交叉反应。对10份肾综合征出血热急性期血清样本进行检测,结果9份为HTNV、1份为SEOV,与巢式RT-PCR方法结果一致。结论建立的双重实时荧光定量RT-PCR方法可以快速对HTNV和SEOV进行分型和定量检测,适用于肾综合征出血热临床早期诊断。

摘要：目的了解江西省汉滩型汉坦病毒(Hantaan virus,HTNV)AYW89-15株的全基因组序列特征。方法设计和运用引物,采用RT-PCR方法分段扩增AYW89-15株的S、M、L全基因,对扩增产物进行克隆和序列测定。运用DNAstar和MEGA6.0软件分析基因序列。结果 AYW89-15株全基因组共有11 848个核苷酸,其中S、M、L基因分别含1 699、3 616、6 533个核苷酸,分别编码429、1 135、2 151个氨基酸。经序列比对,该病毒与国内外HTNV核苷酸同源性为79.7%~87.3%;氨基酸序列同源性为92.3%~98.4%。系统进化分析表明,AYW89-15株在HTNV系统进化树中独立分支。结论AYW89-15株为HTNV新的基因亚型,江西省存在新基因亚型的HTNV。

摘要：目的了解江西省汉坦病毒新分离株Jiangxi XinjianRn-07-2011的全基因组特征。方法设计特异性引物,分段扩增毒株的S、M、L全基因,对扩增产物进行序列测定,运用DNAStar、Mega 3.1软件对序列进行拼接和分析。结果全S、M、L基因分别含1 772个、3 651个、6 530个核苷酸,分别编码429个、1 133个、2 151个氨基酸,经序列比对和系统进化分析,该病毒属汉城型汉坦病毒（SEOV）,S4亚型。S、M、L 3个基因与SEOV型病毒比较,核苷酸序列同源性分别为88.1%～98.0%、84.0%～96.1%、94.4%～95.9%;氨基酸序列同源性较高,分别为98.2%～100%、98.7%～99.5%、98.2～99.4%。结论测定了江西省新分离株Jiangxi XinjianRn-07-2011的全基因组序列,发现新分离株为SEOV,S4亚型。

摘要：目的了解2010年至2014年江西省儿科呼吸道感染患儿中腺病毒的感染状况及其基因特征。方法 2010年至2014年,共采集呼吸道感染患儿的标本2645份,分别进行了7种常见呼吸道病毒的核酸检测,核酸阳性标本进行病毒分离培养获得毒株。设计可以扩增所有腺病毒基因组Hexon基因片段、feiber基因片段的引物,毒株进行扩增,PCR的产物直接进行测序,测序结果与Gen Bank的已知型别的序列进行比对,确定腺病毒的型别。结果在2645份呼吸道标本中,核酸检测腺病毒的阳性标本数为259份,阳性率9.79%,对259份核酸阳性标本进行病毒分离,得到46份毒株,病毒分离率为17.76%。46份标本进行PCR、测序、序列比对分析得知:1型ADV为7例,占15.22%,2型ADV为14例,占30.43%,3型ADV为8例,占17.39%,5型ADV为7例,占15.22%,6型ADV为1例,占2.17%,7型ADV为9例,占19.57%。结论 2010年至2014年,南昌地区的腺病毒感染以2型、3型、7型为主,1型、5型、6型比较少见,暂时未发现新的型别引起的感染。