摘要：水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,也是维护水生态健康的关键。传统的水生生物监测存在技术要求高、时间和人力成本高、难以标准化和自动化等诸多问题。环境DNA(eDNA)技术可以利用环境中残留的DNA分子解决与物种识别、分布和多样性相关的生物学问题,为水生生物监测提供一个准确和便捷的方法。文章梳理了eDNA技术的基本原理和2014-2023年eDNA技术的研究进展,尤其是eDNA技术在水生生物监测中的应用;归纳总结了eDNA技术的使用限制、最佳使用方案、实验中污染的来源和实行eDNA技术标准化的可行性等各类问题;概括了从实验设计到样品处理的10个关键影响因素,并提出了建立物种数据库、建立特定实验室、优化野外和实验室流程等方式来推动eDNA技术的标准化和自动化,以期为解决eDNA技术应用上面临的一系列问题提供借鉴。