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面向合成生物学的机器学习方法及应用
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《科学通报》2021年 第3期66卷 284-299页
作者:胡如云 张嵩亚 蒙海林 余函 张建志 罗小舟 司同 刘陈立 乔宇中国科学院深圳先进技术研究院先进计算与数字工程研究所深圳518055 中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所深圳518055 深圳合成生物学创新研究院深圳518055 中国科学院定量工程生物学重点实验室深圳518055 广州中国科学院先进技术研究所生物工程研究中心广州511458 
机器学习的目标是设计可以根据先验知识和观测数据不断改进其性能的算法.该算法可以帮助机器从大量的数据中提取知识,从而提升其在特定任务上的性能.作为数据驱动的方法,机器学习可以有效利用高通量实验技术产生的大批量生物数据,实现...
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酿酒酵母中基于CRISPR/dCas9的基因转录调控工具的开发与应用
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《生物技术通报》2020年 第4期36卷 1-12页
作者:陈永灿 张建志 司同中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院深圳518055 
酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是重要的模式真核微生物,广泛用于基础研究和工业发酵。基于CRISPR/dCas9系统开发的转录调控方法具有可编程、多重性和正交性等优点,在酿酒酵母的基因调控、功能基因组学、代谢工程等研究领域具有巨...
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自动化合成生物技术与工程化设施平台
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《科学通报》2021年 第3期66卷 300-309页
作者:唐婷 付立豪 郭二鹏 张振坤 王子宁 马辰飞 张智彧 张建志 黄建东 司同中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室深圳518055 
合成生物学采用工程化设计理念,对生物体进行有目标的设计、改造,甚至从头合成具有特定功能的“人造生命”,用于探索生命活动规律和进行生物技术创新.由于生命系统高度复杂,人工设计的合成生命体很难完全按照预期工作,往往需要长时间的...
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自动化合成生物技术在DNA组装与微生物底盘操作中的应用
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《合成生物学》2023年 第5期4卷 857-876页
作者:陈永灿 司同 张建志中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东深圳518055 
基于绿色生物制造进行物质能量生产,有望减少对天然植被、耕地、石化等资源的依赖,而微生物细胞工厂是绿色生物制造过程的“芯片”。合成生物学为微生物细胞工厂的研究提供了重要的使能技术,但目前仍面临生命系统高度复杂、实验过程需...
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先锋的情感——余华先锋小说中的“弑父”情结及其动因的解读
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《社科纵横(新理论版)》2010年 第2期 135-137页
作者:卞加林 司同徐州师范大学江苏徐州221116 
余华作为中国先锋小说家的代表在创作上具有强烈的反传统的个性。他选择的"弑父"主题也正体现了这一点。余华通过弑父策略的运用使自己的作品打上了浓重的个性标签,他采用虚化、弱化、丑化父亲来表现他的文学个性和观念,而这...
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合成生物数据库与大数据智能分析展望
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《生命科学》2021年 第12期33卷 1483-1492页
作者:胡如云 陈永灿 张建志 郭二鹏 付立豪 乔宇 司同中国科学院深圳先进技术研究院深圳518055 
合成生物通过"设计-构建-测试-学习"闭环研究积累海量数据,推动合成生物数据储存、共享和分析等方面的发展。该文以合成生物数据库和数据智能分析为核心内容,描述了合成生物数据库建设的现状,讨论了合成生物数据质控和标准、...
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中医门诊医生工作站软件的设计与实现
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《中国临床康复》2006年 第43期10卷 183-185页
作者:司同 林忻 杨玉文 支楠 王虹 于涛 刘淑珍 吕泽中国康复研究中心北京博爱医院中医康复科北京市100068 杭州创业软件股份有限公司北京市100050 北京同仁医院传统医学科北京市100730 北京亚泰门诊部北京市100013 中国航遥中心门诊部北京市100083 北京积水潭医院中医骨科北京市100035 
目的:用于中医门诊病历的书写记录和处方的快速检索、选取、打印,提高医生工作效率。方法:第一作者提出设计方案,编写组按要求依据中华人民共和国国家标准、全国高等中医药院校规划教材、《中华人民共和国药典》一部2005版,共编辑了22类...
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基于合成生物学策略的酶蛋白元件规模化挖掘
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《合成生物学》2020年 第3期1卷 319-336页
作者:张建志 付立豪 唐婷 张嵩亚 朱静 李拓 王子宁 司同中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东深圳518055 
生物制造以人工生物体系为催化剂合成工业化学品、药物和功能材料,具有低碳循环、绿色清洁等特征。酶蛋白是构建生物催化系统的重要功能单元,然而,由于缺乏准确预测序列-功能关系的方法,目前酶的理性设计仍面临巨大挑战。因此,需要利用...
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AIGC绘画在符号学视域下的价值重构
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《美术文献》2024年 第1期207卷 23-25页
作者:司同南京信息工程大学艺术学院江苏南京210044 
文章主要从符号学视角对AIGC绘画生成的运行模式进行分析,并研究人工智能绘画作品的意义构成及美学价值:首先,从早期计算机生成艺术作品到当前深度学习算法的应用出发,回顾人工智能技术在绘画领域的发展历程,并对AIGC生成行为的符号化...
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女性主义视域下李宗盛情歌与花间词中的女性形象比较
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《许昌学院学报》2021年 第6期40卷 61-63页
作者:司同阿尔伯塔大学人文学院加拿大埃德蒙顿T6G 2H8 
李宗盛的情歌创作与晚唐五代花间词的创作共通的艺术形式和相近的文本内容为二者在女性主义文学批评视域下进行比较提供了可能。花间词中女性形象的虚实相间、写作手法的重容貌服饰之描摹、语言形式的参差及主观情感的投入、男性意识的...
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