摘要：目的建立一种基于单碱基改变基因分型的快速检测等位基因特异性双向PCR原理的改良SNP分型新方法:双向等位基因特异性PCR(Bi-PASA)在一次PCR反应中区分纯合子和杂合子的方法。方法以SNP位点rs11293201和rs57148397为例,设计两个外部引物(F与R)和两个内部等位基因特异性引物(P与Q)。同时与测序方法对比检测突变。结果两个内部引物(P和Q)包含一个相对短的完全匹配区域和一个富含GC的10核苷酸5′尾。当基因组DNA被先期扩增出的模板DNA取代时内引物完成从低效扩增到高效扩增的转变,其结果与直接测序完全一致。利用Bi-PASA参数的优化在人类SIP1基因常见突变的外显子中详细研究先天性巨结肠病,3种额外的Bi-PASA分析被快速优化。结论Bi-PASA是一种简单快速而有效的SNP分型新方法,是在一个PCR反应中检测已知突变的方法。

摘要：鉴定抗磷脂综合征患者来源的抗纤溶酶单抗CL15所识别的结构域，并运用生物信息学和计算机辅助设计对CL15进行表位分析。使用分子克隆的方法克隆并纯化了纤溶酶的结构域，ELISA方法检测CL15对天然纤溶酶和微小纤溶酶的结合能力。根据CL15的抗体的互补区（CDR）的已知序列，在PBD蛋白库中进行同源比较，获得了同源性较高的单抗IMFA的Fab段的晶状结构，用计算机软件把CL15的CDR区序列优化进入IMFA后，根据结构域的空间结构与CL15进行对接。结果，高亲和力结合纤溶酶的单抗CL15识别纤溶酶的结构域，通过对CL15的晶体结构的同源模建，计算机模拟与微小纤溶酶结合，CL15在纤溶酶的酶活性区的606～789中的部分氨基酸序列有明显的相互作用，存在表位为空问构象，能将纤溶酶的丝氨酸活化中心屏蔽。CL15能识别微小纤溶酶，抗原表位在纤溶酶的丝氨酸的活性中心区域。CL15能阻断丝氨酸蛋白酶的活性中心的关键氨基酸，降低纤溶酶的活性，可能是最终导致抗磷脂综合征病人血栓形成的原因之一。