摘要：近年来不同学科领域的语义数据井喷式增长,关联数据集关联关系的发布形式直接决定了这些数据集能否被快速、准确地理解和使用。目前,数据集关联关系的发布均采用文本,而本论文提出一种基于本体可视化的方法来表达关联数据集,使数据集更容易被理解和使用。设计关联数据集发布方案,基于OWL2VOWL项目实现将关联关系转化为WebVOWL规定格式的JSON元素,并将其结合WebVOWL嵌入到发布模型中,完成关联数据集关联关系的发布。依据以微生物为核心的关联数据集的关系可视化表示,完成在数据集上的查询,验证方案带来的便利。通过设计的本体可视化模型来完成关联数据集的表达,丰富了关联数据集的发布形式,并使得关联数据集更容易被专家甚至不懂本体的使用者理解和使用。

摘要：目的探讨探针长度对寡核苷酸(Oligo)基因芯片杂交信号的影响。方法以大肠杆菌基因表达信息作为实验模型,根据已有大肠杆菌全基因组芯片数据选择覆盖高、中、低杂交信号强度的20个大肠杆菌基因,针对该20个基因分别设计59-mer和70-mer长度Oligo探针,并将2种探针点制在同一张芯片中,同时设阳性对照探针和阴性对照点样液。提取大肠杆菌RNA,经过反转录、扩增、荧光标记后与芯片进行杂交反应,采用激光共聚焦扫描仪扫描芯片,利用数据分析软件提取探针的杂交信号值并进行显著性分析。结果大肠杆菌28SrRNA和18SrRNA条带清晰,无降解带出现,质量合格。芯片杂交结果显示59-mer和70-mer长度探针的杂交效率和杂交信号差异无统计学意义(P=0.9810),阳性对照探针出现阳性杂交信号,阴性对照点样液未检测到杂交信号,符合质控要求。结论59-mer长度探针可用来制备Oligo基因芯片,这不仅降低了基因芯片制作成本,而且将推动基因芯片技术更为普及的应用。

摘要：湿地是上海市城市生态系统的重要组成部分,但其面积在过去几十年间显著减少,影响了城市生态系统服务的供给。通过构建系统动力学模型模拟上海市湿地生态系统服务变化的过程与未来情景。研究表明:(1)该模型有效且具有实际仿真的可操作性,并可根据政策要求设定参数,对上海市湿地生态系统服务价值的变化进行模拟与预测,结果可为上海市制定湿地保护或生态规划政策提供可行性分析。(2)对4种不同"湿地面积增长率"的情景进行模拟,结果显示了未来经济以不同增速条件发展时湿地生态系统服务价值的变化:无论哪种情景,文化服务价值最高,占总价值的64%以上,且在研究时段内呈增长趋势;调节服务价值次之,呈增长趋势;供给服务价值最低,呈下降趋势。(3)到2025年,按照现行的政策,上海市湿地面积将减少至37.92×10^4hm^2,届时湿地生态系统服务价值为4711.56×10^8元,占上海市国内生产总值的20%,人均1.95×10^4元。