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基于子块矩阵马尔可夫聚类识别动态蛋白质相互作用网络功能模块: 收藏
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引用; 《基因组学与应用生物学》2024年第2期43卷 217-227页; 作者：张锦雄潘扬健孟雪莉唐伊红巴依提力·努尔旦艾力王鑫左振文陈清华郭顶亮韦冰冰陈陆坤广西大学计算机与电子信息学院南宁530004 广西高校并行分布与智能计算重点实验室南宁530004; 细胞生物过程具有时序动态性,蛋白质功能模块是驱动细胞生物过程的功能单位。为了蛋白质功能模块识别,本文将细胞生物过程建模为动态时序表达相关蛋白质相互作用网络(DTEPIN);构建子块矩阵以表示动态时序表达相关蛋白质相互作用网络;利...; 细胞生物过程具有时序动态性,蛋白质功能模块是驱动细胞生物过程的功能单位。为了蛋白质功能模块识别,本文将细胞生物过程建模为动态时序表达相关蛋白质相互作用网络(DTEPIN);构建子块矩阵以表示动态时序表达相关蛋白质相互作用网络;利用子块矩阵特殊性,分析时空复杂度和并行性;优化设计马尔可夫聚类算法,以识别动态时序表达相关蛋白质相互作用网络中的蛋白质功能模块。为了支持基于子块矩阵马尔可夫聚类过程,本文运用图形处理器并行计算矩阵乘积。实验结果表明,与已有同类算法相比,所设计算法识别的蛋白质功能模块,统计匹配质量更高且精确匹配数量更多。; 来源：详细信息评论

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