摘要：为构建牛源ISG 15基因的过表达载体,以GenBank中牛源ISG 15基因序列作为参考序列设计1对合成引物,通过扩增ISG 15基因,构建pMD-18T-ISG15克隆质粒和pEGFP-N1-ISG15表达质粒,转染MDBK细胞并进行间接免疫荧光(IFA)检测。结果:经PCR扩增、测序验证,pEGFP-N1-ISG15重组表达质粒构建成功;IFA检测显示,转染pEGFP-N1-ISG15重组质粒的MDBK细胞中有明显绿色荧光信号。结论:试验成功构建了牛源ISG 15基因的过表达载体,并在MDBK细胞中成功表达。

摘要：[目的]对鸡importin β1基因进行克隆和生物信息学分析。[方法]根据Gen Bank公布的鸡importin β1基因序列(XM_015299473)设计合成特异性引物,通过RT-PCR从DF-1细胞中扩增importin β1基因CDS区并进行克隆和测序,利用生物信息学工具对其理化性质、二级结构和系统进化树进行分析。[结果]鸡importin β1基因CDS全长2 268bp,共编码755个氨基酸,该蛋白等电点为4.61,相对分子质量84.15 k Da,分子式为C3712H5901N979O1152S46。蛋白质二级结构预测显示,鸡importin β1蛋白含有丰富的二级结构,以α-螺旋为主(占64.90%)。importin β1基因同源性及系统进化树分析结果表明鸡与鹌鹑的亲缘关系最近。[结论]鸡importin β1基因的克隆和生物信息学分析为进一步研究其功能奠定了基础。

摘要：根据GenBank发表的鸭白细胞介素2(IL-2)基因序列,设计合成一对特异性引物,从刀豆蛋白A(ConA)诱导的三穗麻鸭颈外周血淋巴细胞中提取总RNA,通过RT-PCR方法扩增三穗麻鸭IL-2基因并进行克隆与序列分析。测序结果表明,三穗麻鸭IL-2基因编码区序列全长为423bp,共编码140个氨基酸,预测的分子式为C695H1125N175O226S13。序列分析显示,三穗麻鸭与绿头鸭、番鸭、绍兴麻鸭的IL-2基因核苷酸同源性最高(为98.3%);与其它水禽IL-2蛋白氨基酸序列相比,在29(N/D)、32(K/T)、49(D/N)、58(T/K)、90(K/N)、105(M/T)、122(N/K)和129(Q/R)存在8处氨基酸位点变异,仅有L66、C68、E72和F1274个氨基酸是三穗麻鸭和人与其它动物IL-2均保守的位点。本研究对进一步研究三穗麻鸭IL-2的生物学功能以及开发疫苗免疫佐剂奠定了基础。

摘要：旨在利用GST pull-down技术验证新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)基质(matrix,M)蛋白与鸡importinβ1蛋白在体外的相互作用。根据NDV ZJ1株M基因和鸡importinβ1基因序列设计引物,通过PCR扩增获得NDV M基因和鸡importinβ1基因,将其分别定向插入到原核表达载体pGEX-6p-1和pET-32a(+)构建重组原核表达载体pGEX-6p-M、pET-32a-importinβ1,然后转化至大肠杆菌BL21(DE3)后进行IPTG诱导表达,SDSPAGE检测重组蛋白的表达情况,并对包涵体重组蛋白进行变性和复性处理。然后以GST-M重组蛋白为诱饵蛋白,His-importinβ1重组蛋白为猎物蛋白,利用GST pull-down技术验证M蛋白与importinβ1蛋白的相互作用。结果表明,成功构建了重组原核表达载体pGEX-6p-M和pET-32a-importinβ1,将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)获得了正确表达。SDS-PAGE电泳检测显示GST-M重组蛋白主要以包涵体形式存在,而His-importinβ1重组蛋白以可溶性和包涵体两种形式存在。利用蛋白重折叠试剂盒获得了有活性的GST-M重组蛋白,将其作为诱饵蛋白,可以捕获并检测到His-importinβ1重组蛋白,但是GST标签蛋白不能结合His-importinβ1重组蛋白。利用GST pull-down技术证实了NDV M蛋白与鸡importinβ1蛋白在体外具有直接的相互作用,这为深入研究importinβ1蛋白在NDV M蛋白细胞核定位的分子机制以及在NDV复制和致病中的作用奠定了基础。

摘要：为探究山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞和气管上皮细胞(BECs)后的抗病毒免疫应答,本研究针对7种干扰素刺激基因(ISGs):IFI6、ISG15、OAS1Y、OAS1Z、Mx1、Mx2及RSAD2的基因序列设计特异性引物,经优化建立了检测7种ISGs的SYBR Green I荧光定量PCR方法。利用所建立的方法检测CPIV3JS2013株感染MDBK细胞和BECs 24 h、48 h和72 h后7种ISGs的m RNA转录水平。结果显示,在MDBK细胞中,CPIV3感染时间越长,7种ISGs的转录水平上调倍数越高,其中ISG15、Mx1、Mx2和RSAD2的m RNA转录水平上调量持续高于IFI6、OAS1Y和OAS1Z;而在BECs中,CPIV3感染后虽然IFI6、ISG15、OAS1Y、OAS1Z、Mx1、Mx2和RSAD2 m RNA转录水平均出现上调,但ISG15、Mx2和RSAD2的m RNA转录水平上调量高于IFI6、OAS1Y、OAS1Z和Mx1。结果表明,CPIV3 JS2013株可以刺激MDBK细胞和BECs中这7种ISGs的大量转录,本研究为进一步探究其抗病毒功能提供了实验依据。

摘要：根据GenBank已发表的鸡基质蛋白3(matrin 3)基因序列,设计合成一对特异性引物,以鸡胚成纤维细胞提取的总RNA反转录产物为模板,通过PCR扩增鸡matrin 3基因并进行克隆与生物信息学分析。测序结果表明:鸡matrin 3基因编码区全长为2 709 bp,共编码902个氨基酸,理论pI为5.79,分子质量约为100.71 ku,分子式为C_(4362)H_(6903)N_(1267)O_(1418)S_(29)。序列分析结果显示:鸡matrin 3蛋白有丰富的二级结构,以无规则卷曲和α-螺旋为主;该蛋白中包含两个锌指结构域和两个RNA识别基序,其中人、小鼠和野猪的4个功能结构域氨基酸位点相同,而在鸡matrin 3蛋白中存在多个氨基酸位点变异。核苷酸同源性及遗传进化分析发现:鸡与火鸡的matrin 3基因核苷酸同源性最高(为98.0%),并且与火鸡的亲缘关系最近。研究结果为进一步研究鸡matrin 3蛋白的生物学功能奠定了基础。

摘要：为了建立一种有效、快速、准确的鸭坦布苏病毒(DTMUV)TaqMan探针实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法,本试验针对NCBI发布的DTMUV E基因保守序列设计特异性引物和探针,建立qPCR反应体系。通过制备的标准质粒建立标准曲线,评估该方法的特异性、敏感性和重复性,并使用该方法对临床样本进行检测。结果显示,所建立的标准曲线相关系数为0.999 5,有良好的线性关系;该方法可特异检测DTMUV;对标准质粒的最低检测限为2.72×10^(2) copies/μL,是普通PCR的100倍;CT值组内变异系数为0.97%~1.32%,组间变异系数为1.24%~1.79%;人工感染DTMUV的20份鸭胚成纤维细胞样本以及12份人工攻毒2 d的雏鸭脾脏组织样本和12份泄殖腔棉拭子样本阳性率为100%(44/44);疑似感染的12份活鸭泄殖腔棉拭子阳性率为25.00%(3/12),14份病死鸭脾脏组织样本阳性率为28.57%(4/14)。结果表明,本试验建立的TaqMan探针qPCR方法有良好的敏感性、准确性和重复性,能特异检测DTMUV,适用于临床快速检测,为DTMUV的分子流行病学调查和临床疾病诊断提供了技术支撑。

摘要：[目的]为检测鸭感染H6N6亚型AIV后排毒及在组织器官病毒分布情况。[方法]通过建立H6N6亚型AIV荧光定量PCR检测方法,以H6N6亚型AIV M基因保守序列设计特异性引物,将分离到的H6N6亚型AIV病毒反转录为cDNA,进行pMD18-T-M基因克隆质粒构建,以其为标准品建立荧光定量PCR标准曲线,并进行敏感性和重复性试验,利用所建立的方法检测鸭感染H6N6亚型AIV后排毒及在组织器官病毒分布情况。[结果]该方法灵敏度高,最低检测到1.0×10^(1) copies/μL,从而可以得出拷贝数与Ct值之间的线性关系曲线表达式:Ct=-3.408×lg Copynumber+33.773(R^(2)=0.998),线性范围为1.0×10^(7)~1.0×10^(1)拷贝/μL,熔解峰的熔解温度在83℃左右。[结论]表明建立的鸭源H6N6亚型AIV荧光定量PCR检测方法,特异性强,重复性好,为后续实验研究提供了技术和数据支撑。

摘要：为了分析犬干扰素β(IFN-β)基因分子特征,预测其编码蛋白质的生物学功能,根据GenBank登录的犬IFN-β基因序列(FJ194477)设计合成特异性引物,通过PCR从外周血淋巴细胞总DNA中扩增IFN-β基因CDS区并克隆,应用生物信息学方法对犬IFN-β基因进行序列分析,并对其理化性质以及编码蛋白的二级结构、三级结构进行预测,构建分子系统进化树。结果表明:犬IFN-β基因编码区全长561 bp,共编码186个氨基酸,其分子式可表示为C_(1014)H_(1593)N_(263)O_(290)S_9,分子质量为22.40 ku;属于亲水性蛋白,理论等电点为5.98;含有丰富的二级结构,以α-螺旋(76.88%)和无规则卷曲(19.35%)为主,蛋白三级结构呈弯曲螺旋结构;与貉、威德尔海豹、金钱豹、家猫、宽吻海豚、人、鸡和绿头鸭相对应序列核苷酸序列同源性分别为98.4%、87.2%、85.2%、84.7%、79.0%、74.9%、43.9%和43.3%。说明犬与貉IFN-β核苷酸同源性最高,亲缘关系最近。

摘要：[目的]对从江香猪λ1干扰素(interferon-λ1,IFN-λ1)基因进行扩增、克隆和生物信息学分析。[方法]根据Gen Bank登录的猪IFN-λ1基因序列(FJ455508)设计合成特异性引物,通过RT-PCR从淋巴细胞中扩增IFN-λ1基因CDS区并进行克隆和生物信息分析。[结果]从江香猪IFN-λ1基因CDS全长576 bp,共编码191个氨基酸,其分子式为C949H1543N277O270S7,相对分子质量21.38 k Da;该蛋白等电点为9.42,为亲水性蛋白。从江香猪IFN-λ1含有丰富的二级结构,以α-螺旋(64.40%)和无规卷曲(25.65%)为主,蛋白质三级结构中主要以α-螺旋为主,同源性及系统进化树分析结果表明从江香猪与野猪IFN-λ1核苷酸同源性最高(为100%),亲缘关系最近。[结论]从江香猪IFN-λ1基因的克隆和生物信息学分析为进一步研究其抗病毒功能奠定了基础。