摘要：为研究长江口日本鳗鲡玻璃鳗肠道菌群的结构与多样性特征,初步探究野生鳗鲡仔鱼的营养需求,分别采集浙江台州市、舟山市以及江苏盐城市邻近海域的玻璃鳗样品,利用16S rDNA扩增子测序技术,分析三个采样点玻璃鳗肠道优势菌群及营养代谢相关的功能差异。结果显示,三个采样点的玻璃鳗肠道菌群均以变形菌门(Proteobacteria,68.7%~82.0%)和放线菌门(Actinobacteria,4.2%~19.0%)为主要优势菌门。在属分类水平上,不动杆菌属(Acinetobacter,12.4%~17.3%)和假单胞菌属(Pseudomonas,8.07%~13.03%)丰度较高,属固定优势菌属。此外,每个采样点样本中都含有丰富的独特细菌群,包括台州市的气单胞菌属(Aeromonas)、舟山市的内生单胞属(Endozoicomonas)和丙酸杆菌属(Cutibacterium)以及盐城市的嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和稳杆菌属(Empedobacter),推测是受采样点不同水环境因素影响。不动杆菌、假单胞菌、内生单胞菌等菌属在多种鱼类肠道中有着消化蛋白质的功能,气单胞菌虽属于纤维素降解菌,也可分泌胞外蛋白酶。此外,通过对玻璃鳗肠道菌群进行功能预测发现,三个采样点玻璃鳗菌群功能均以氨基酸的转运和代谢占比最高,推测玻璃鳗在洄游过程中可能摄取较多的蛋白质成分作为其饵料。初步探明了我国近海野生玻璃鳗肠道微生物菌群的多样性组成,可为研究野生鳗鲡仔鱼摄食习惯及食物组成提供依据,同时为日本鳗鲡人工繁殖仔稚鱼的饵料设计提供参考。