摘要：为了筛选出具有较强免疫原性的猪圆环病毒3型(Porcine circovirus virus type 3,PCV-3)核衣壳(Cap)蛋白多肽,试验应用生物信息学技术,通过Garnier-Robson和Chou-Fasman两种方法分析PCV-3-Cap蛋白的二级结构,Kyte-Doolittle方法分析亲水性,Karplus-Schulz方法分析柔性,Emini方法分析表面可能性,Jameson-Wolf方法分析抗原性,经对该蛋白生物学特性进行综合分析设计合成PCV-3-Cap蛋白多肽,与钥孔血蓝蛋白(KLH)偶联后作为抗原免疫小鼠,测定免疫后小鼠抗体效价以及血清中免疫球蛋白IgG、IgA和细胞因子干扰素-γ(IFN-γ)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-4(IL-4)的含量。结果表明:PCV-3-Cap蛋白的α-螺旋位于1~29,59~72,77~83,133~142,181~189 aa等区域;β-折叠位于1~15,20~33,37~52,62~111,114~123,131~155,161~167,175~193,203~215 aa等区域;转角位于12~15,32~43,137~144,167~170,174~177 aa等区域;无规则卷曲位于10~12,53~75,113~130,156~159,169~178,202~204 aa等区域;0~46,115~145 aa区域的亲水指数较高;柔性结构主要位于9~21,122~133,152~162 aa等区域;7~30,32~45,54~62,119~148 aa这些区域暴露于蛋白质表面的可能性较大;6~46,121~151 aa区域的抗原指数较高,经综合分析筛选出2段抗原性较好的肽段,分别为30~45 aa(16K)和130~145 aa(17K);2条PCV-3-Cap蛋白多肽均在第4次免疫小鼠后抗体效价达到1∶6 400;四免后小鼠的免疫球蛋白IgG、IgA及细胞因子IFN-γ、IL-6、IL-4含量与对照组相比均显著提高(P<0.05)。说明筛选出的2个PCV-3-Cap蛋白多肽具有较好的抗原性。